Intrón genético en algunos protistas
El intrón del grupo III es una clase de intrones que se encuentran en los genes de ARNm de los cloroplastos en los protistas euglenidos . Tienen un dVI de tipo grupo II convencional con una adenosina abultada, un dI aerodinámico, sin dII-dV y un consenso de sitio de empalme relajado. [1] : fig. 2 El empalme se realiza con dos reacciones de transesterificación con una adenosina abultada en dVI como nucleófilo iniciador ; el intrón se escinde como un lazo. [2] No se sabe mucho sobre cómo funcionan, [1] aunque se ha construido un sistema aislado de transformación de cloroplastos. [3]
Descubrimiento e identificación
En 1984, Montandon y Stutz informaron ejemplos de un nuevo tipo de intrones en el cloroplasto de Euglena . [4] En 1989, David A. Christopher y Richard B. Hallick encontraron algunos ejemplos más y propusieron el nombre "intrones del Grupo III" para identificar esta nueva clase con las siguientes características: [5]
- Los intrones del grupo III son mucho más cortos que otras clases de intrones autoempalmables, y tienen entre 95 y 110 nucleótidos entre los conocidos por Christopher y Hallick e identificados en los cloroplastos. Por otra parte, Christopher y Hallick afirmaron: "En cambio, el intrón más pequeño del grupo II del cloroplasto de Euglena ... tiene 277 nucleótidos". [5]
- Sus secuencias conservadas proximales a los sitios de empalme tienen similitudes con las de los intrones del grupo II, pero tienen menos posiciones conservadas.
- No se corresponden con la estructura secundaria conservada de los intrones del grupo II. (De hecho, Christopher y Hallick no pudieron identificar ningún elemento de estructura secundaria conservada entre los intrones del grupo III).
- Generalmente se asocian con genes involucrados en la traducción y la transcripción.
- Son muy ricos en A+T.
En 1994, el descubrimiento de un intrón del grupo III con una longitud de un orden de magnitud mayor indicó que la longitud por sí sola no es el determinante del empalme en los intrones del grupo III. [2]
El empalme de los intrones del grupo III se produce a través de la formación de ARN circular y en forma de lazo . [2] Las similitudes entre los intrones del grupo III y los nucleares incluyen secuencias de límite 5' conservadas, formación de lazo, falta de estructura interna y capacidad de utilizar límites de empalme alternativos. [1]
Véase también
Referencias
- ^ abc Copertino DW, Hallick RB (diciembre de 1993). "Intrones del grupo II y del grupo III de twintrons: relaciones potenciales con intrones nucleares pre-ARNm". Trends Biochem. Sci . 18 (12): 467–71. doi :10.1016/0968-0004(93)90008-b. PMID 8108859.
- ^ abc Donald W. Copertino DW; Hall ET; Van Hook FW; Jenkins KP; Hallick RB (1994). "Un twintron del grupo III que codifica un gen similar a la madurasa se escinde a través de intermediarios lariat". Nucleic Acids Res . 22 (6): 1029–36. doi :10.1093/nar/22.6.1029. PMC 307926 . PMID 7512259.
- ^ Doetsch, NA; Favreau, MR; Kuscuoglu, N; Thompson, MD; Hallick, RB (febrero de 2001). "Transformación de cloroplastos en Euglena gracilis: empalme de un twintron del grupo III transcrito a partir de un operón psbK transgénico". Genética actual . 39 (1): 49–60. doi :10.1007/s002940000174. PMID 11318107. S2CID 6413004.
- ^ Montandon PE, Stutz E (septiembre de 1983). "Secuencia de nucleótidos de una región del genoma del cloroplasto de Euglena gracilis que codifica el factor de elongación Tu; evidencia de un ARNm empalmado". Nucleic Acids Res . 11 (17): 5877–92. doi :10.1093/nar/11.17.5877. PMC 326324 . PMID 6310519.
- ^ ab Christopher DA, Hallick RB (octubre de 1989). "Operón de proteína ribosomal del cloroplasto de Euglena gracilis: un nuevo gen de cloroplasto para la proteína ribosomal L5 y descripción de una nueva categoría de intrones de orgánulos designada como grupo III". Nucleic Acids Res . 17 (19): 7591–608. doi :10.1093/nar/17.19.7591. PMC 334869 . PMID 2477800.
Enlaces externos
