El gobernador de Zamboanga del Sur es el jefe ejecutivo local de la provincia filipina de Zamboanga del Sur . El gobernador ejerce su cargo en la capital provincial de Zamboanga del Sur. Como todos los jefes de gobierno local en Filipinas, el gobernador es elegido por votación popular y no puede ser elegido para un cuarto mandato consecutivo (aunque el exgobernador puede volver al cargo después de un intervalo de un mandato). En caso de muerte, renuncia o incapacidad, el vicegobernador se convierte en gobernador.
Antes de 1952, toda Zamboanga estaba gobernada por gobernadores designados o elegidos en las históricas provincias de Moro (1903-1914) y de Zamboanga (1914-1952) . Después de 1952, el entonces gobernador de Zamboanga, Serapio J. Datoc, se convirtió en el primer gobernador de la provincia.
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