Federico Guillermo II ( Weimar , 12 de febrero de 1603 - Altenburg , 22 de abril de 1669 ), fue duque de Sajonia-Altenburgo.
Fue el hijo menor de Federico Guillermo I, duque de Sajonia-Weimar , y de Ana María del Palatinado-Neoburgo , su segunda esposa. Nació ocho meses después de la muerte de su padre, el 7 de julio de 1602.
Poco después de su nacimiento, Federico Guillermo II y sus hermanos mayores heredaron Sajonia-Altenburgo como co-gobernantes bajo la tutela de los electores de Sajonia Cristián II y Juan Jorge I hasta 1618, cuando su hermano mayor Juan Felipe asumió el gobierno del ducado y la tutela de sus hermanos menores.
En 1632, dos de sus tres hermanos habían fallecido. Federico Guillermo II y su hermano mayor, Juan Felipe, iniciaron un gobierno conjunto; pero, de hecho, Juan Felipe era el verdadero y único gobernante del ducado de Sajonia-Altenburgo. Federico Guillermo II fue sólo un gobernante nominal hasta la muerte de Juan Felipe (1639), cuando comenzó su reinado personal sobre Altenburgo.
El 18 de septiembre de 1638, en el castillo de Altenburgo, Federico Guillermo II se casó con su primera esposa, Sofía Isabel , hija única de Cristián Guillermo de Brandeburgo . Ella murió en 1650 después de doce años de matrimonio sin hijos.
El 11 de octubre de 1652, en Dresde, Federico Guillermo II se casó en segundas nupcias con Magdalena Sibila de Sajonia , princesa viuda heredera de Dinamarca e hija de su anterior regente, el elector Juan Jorge I. Tuvieron tres hijos:
En 1660 adquirió las ciudades de Themar y Meiningen . En 1664 construyó un castillo de caza ( Jagdschloss ) en Hummelshain y en 1665 construyó un castillo de viuda ( Witwensitz ) particularmente hermoso, llamado "Magdalenenstift", en Altenburg para su esposa Magdalene Sybille.
Después de su muerte fue sucedido por su segundo y único hijo sobreviviente, Federico Guillermo III.