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Michael Fischbach

Michael Andrew Fischbach (nacido el 3 de noviembre de 1980) es un químico, microbiólogo y genetista estadounidense. Es profesor asociado de Bioingeniería y miembro de la facultad de ChEM-H en la Universidad de Stanford [1] [2] e investigador del Chan Zuckerberg Biohub . [3]

Educación

Fischbach obtuvo su licenciatura en Ciencias Bioquímicas en la Universidad de Harvard en 2003. Durante ese tiempo (2000-2003), trabajó en el laboratorio de Jeffrey Settleman en el Centro Oncológico del Hospital General de Massachusetts en la bioquímica de mutantes oncogénicos de la pequeña GTPasa Ras . [4] En 2007, obtuvo su doctorado en Química y Biología Química en la Universidad de Harvard, trabajando en el laboratorio de Christopher T. Walsh en la Facultad de Medicina de Harvard en la adquisición de hierro en patógenos bacterianos y la bioquímica de la biosíntesis de productos naturales. [5] [6]

Carrera

Fischbach fue investigador junior en el Departamento de Biología Molecular del Hospital General de Massachusetts (2007-2009) antes de unirse a la facultad de la Universidad de California, San Francisco en 2009. Se trasladó a la Universidad de Stanford como profesor asociado en septiembre de 2017. Como investigador de Chan Zuckerberg Biohub, Fischbach es uno de los ocho miembros de la facultad en Stanford, UCSF y la Universidad de California, Berkeley que lideran la Iniciativa de Microbioma CZ Biohub, lanzada en 2018, con el objetivo de comprender cómo la microbiota puede influir en la salud humana. [7]

Fischbach es actualmente miembro del consejo asesor científico de NGM Biopharmaceuticals [8] y cofundador de Revolution Medicines. [9]

Investigación

El laboratorio de Fischbach se centra en descubrir y caracterizar pequeñas moléculas de microorganismos, con énfasis en el microbioma humano. [10] [11]

Pequeñas moléculas de la microbiota humana

En 2014, Fischbach y su laboratorio publicaron un estudio de genes biosintéticos en el microbioma humano , que describe la capacidad de los microbios asociados a los humanos para producir antibióticos tiopéptidos . [12] [13] [14] [15] El laboratorio de Fischbach descubrió que el comensal intestinal Bacteroides fragilis produce el esfingolípido inmunomodulador alfa-galactosilceramida, [16] mostró que la producción de neurotransmisores es común entre las bacterias intestinales comensales, [17] y descubrió la vía biosintética para una clase común de ácidos biliares producidos por las bacterias intestinales. [18]

Enfoques computacionales para el descubrimiento de productos naturales

El laboratorio de Fischbach desarrolló un algoritmo, ClusterFinder, que automatiza el proceso de identificación de genes biosintéticos para moléculas pequeñas en secuencias del genoma bacteriano. [19] [20] Con Marnix Medema, co-desarrolló un segundo algoritmo para identificar grupos de genes biosintéticos, antiSMASH, [21] con el que se ha fusionado ClusterFinder.

Vida personal

Fischbach está casado con Elizabeth Sattely , profesora asociada de Ingeniería Química en Stanford. [22]

Enlaces externos

Referencias

  1. ^ "Perfil de Michael Fischbach | Perfiles de Stanford". profiles.stanford.edu . Consultado el 12 de julio de 2019 .
  2. ^ "Faculty Fellows | ChEM-H". chemh.stanford.edu . Consultado el 12 de julio de 2019 .
  3. ^ "Programa de investigadores – Biohub de Chan Zuckerberg" . Consultado el 12 de julio de 2019 .
  4. ^ Fischbach MA, Settleman J. Inactivación bioquímica específica de proteínas Ras oncogénicas por la nucleósido difosfato quinasa. Cancer Res. 15 de julio de 2003;63(14):4089-94. PMID  12874011.
  5. ^ Fischbach MA, Lin H, Liu DR, Walsh CT. Caracterización in vitro de IroB, una C-glicosiltransferasa asociada a patógenos. Proc Natl Acad Sci US A. 18 de enero de 2005;102(3):571-6. Publicación electrónica 14 de diciembre de 2004. PMID  15598734; PMC  545562.
  6. ^ Walsh CT, Fischbach MA. Productos naturales versión 2.0: conectando genes a moléculas. J Am Chem Soc. 3 de marzo de 2010;132(8):2469-93. doi :10.1021/ja909118a. PMID  20121095; PMC  2828520.
  7. ^ "Chan Zuckerberg Biohub financia nuevos esfuerzos de investigación, iniciativa sobre el microbioma". Centro de noticias . 8 de febrero de 2017 . Consultado el 12 de julio de 2019 .
  8. ^ "Consejo asesor científico - NGM Bio". www.ngmbio.com . Archivado desde el original el 2018-07-20 . Consultado el 2016-01-07 .
  9. ^ "Equipo - Medicinas Revolucionarias". revolutionmedicines.com .
  10. ^ "Grupo Fischbach - Inicio". fischbachgroup.org .
  11. ^ Donia MS, Fischbach MA. Moléculas pequeñas de la microbiota humana. Science. 24 de julio de 2015;349(6246):1254766. doi :10.1126/science.1254766. Publicación electrónica 23 de julio de 2015. Revisión. PMID  26206939; PMC  4641445
  12. ^ Donia MS, Cimermancic P, Schulze CJ, Wieland Brown LC, Martin J, Mitreva M, Clardy J, Linington RG, Fischbach MA. Un análisis sistemático de los grupos de genes biosintéticos en el microbioma humano revela una familia común de antibióticos. Cell. 11 de septiembre de 2014;158(6):1402-14. doi :10.1016/j.cell.2014.08.032. PMID  25215495; PMC  4164201.
  13. ^ "Explotación minera de antibióticos, justo bajo nuestras narices". The New York Times . 11 de septiembre de 2014.
  14. ^ Park, Alice (12 de septiembre de 2014). «Medicamentos caseros: pronto se podrán fabricar antibióticos a partir de bacterias propias». Time . Consultado el 26 de abril de 2018 .
  15. ^ "Pon a un ladrón... Las bacterias que acompañan a la humanidad son un buen lugar para buscar nuevos fármacos". The Economist . 2014-09-20 . Consultado el 2018-04-26 .
  16. ^ Wieland Brown LC, Penaranda C, Kashyap PC, Williams BB, Clardy J, Kronenberg M , Sonnenburg JL, Comstock LE, Bluestone JA, Fischbach MA. Producción de α-galactosilceramida por un miembro destacado de la microbiota intestinal humana. PLoS Biol. 2013 Jul;11(7):e1001610. doi :10.1371/journal.pbio.1001610. Epub 2013 Jul 16. PMID  23874157; PMC  3712910.
  17. ^ Williams BB, Van Benschoten AH, Cimermancic P, Donia MS, Zimmermann M, Taketani M, Ishihara A, Kashyap PC, Fraser JS, Fischbach MA. Descubrimiento y caracterización de las descarboxilasas de la microbiota intestinal que pueden producir el neurotransmisor triptamina. Cell Host Microbe. 8 de octubre de 2014; 16(4): 495-503. doi : 10.1016/j.chom.2014.09.001. Publicación electrónica 25 de septiembre de 2014. PMID  25263219; PMC  4260654.
  18. ^ Devlin AS, Fischbach MA. Una vía biosintética para una clase destacada de ácidos biliares derivados de la microbiota. Nat Chem Biol. 2015 Sep;11(9):685-90. doi :10.1038/nchembio.1864. Publicación electrónica 20 de julio de 2015. PMID  26192599; PMC  4543561.
  19. ^ Cimermancic P, Medema MH, Claesen J, Kurita K, Wieland Brown LC, Mavrommatis K, Pati A, Godfrey PA, Koehrsen M, Clardy J, Birren BW, Takano E, Sali A, Linington RG, Fischbach MA. Información sobre el metabolismo secundario a partir de un análisis global de grupos de genes biosintéticos procarióticos. Celúla. 17 de julio de 2014; 158 (2): 412-21. doi :10.1016/j.cell.2014.06.034. PMID  25036635; PMC  4123684.
  20. ^ Medema MH, Fischbach MA. Enfoques computacionales para el descubrimiento de productos naturales. Nat Chem Biol. 2015 Sep;11(9):639-48. doi :10.1038/nchembio.1884. PMID  26284671.
  21. ^ "versión bacteriana antiSMASH". antismash.secondarymetabolites.org .
  22. ^ "Perfil de Elizabeth Sattely | Perfiles de Stanford". profiles.stanford.edu . Consultado el 12 de julio de 2019 .