Federico II, duque de Holstein-Gottorp (21 de abril de 1568 - 15 de junio de 1587) fue un noble danés-alemán. Era el hijo mayor del duque Adolfo de Holstein-Gottorp y su esposa, Cristina de Hesse (1543-1604).
Heredó la parte ducal del gobierno en el condominio real danés-ducal de los ducados de Holstein y de Schleswig cuando su padre murió en 1586, y murió sólo un año después.