Familia Holin de BP

Clase de proteínas de transporte transmembrana

La familia de las holinas β-proteobacterianas (BP-Hol) (TC# 1.E.50) es una familia pequeña que incluye miembros derivados de varios fagos de Burkholderia , así como de una especie de Poloromonas . A partir del 3 de abril de 2016, esta familia pertenece a la superfamilia Holin II . Los miembros del Laboratorio de Bioinformática Saier de la Universidad de California en San Diego descubrieron que la familia BP-Hol está más estrechamente relacionada con la familia T7 Holin (TC# 1.E.6). ^[1] Estas proteínas tienen una longitud de 60 a 110 residuos de aminoacilo (aas) y presentan 1 o 2 segmentos transmembrana (TMS). Algunas están anotadas como holinas de tipo II y pueden estar relacionadas con miembros de la familia T7 Holin (TC# 1.E.6), aunque las proteínas BP-Hol siguen sin caracterizarse funcionalmente. Una lista representativa de las proteínas pertenecientes a la familia BP-Hol se puede encontrar en la base de datos de clasificación de transportadores. ^[2]

Véase también

• Holin
• Lisina
• Base de datos de clasificación de transportadores

Lectura adicional

• "BcepMigl_gp72 - Holin - Burkholderia phage BcepMigl - BcepMigl_gp72 gene & protein" (BcepMigl_gp72 - Gen y proteína del fago BcepMigl de Burkholderia). www.uniprot.org . Consultado el 29 de marzo de 2016.
• Gründling, Angelika; Manson, Michael D.; Young, Ry (31 de julio de 2001). "Los Holins matan sin previo aviso". Actas de la Academia Nacional de Ciencias 98 (16): 9348–9352. doi :10.1073/pnas.151247598. ISSN  0027-8424. PMC  55423. PMID  11459934.
• Preston, Gail M.; Studholme, David J.; Caldelari, Isabelle (1 de abril de 2005). "Perfil de los secretomas de las proteobacterias patógenas de plantas". FEMS Microbiology Reviews 29 (2): 331–360. doi :10.1016/j.fmrre.2005.01.001. ISSN  1574-6976. PMID  15808747.
• Reddy, Bhaskara L.; Saier Jr., Milton H. (1 de noviembre de 2013). "Análisis topológicos y filogenéticos de familias y superfamilias de holinas bacterianas". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Biomembranas 1828 (11): 2654–2671. doi :10.1016/j.bbamem.2013.07.004. PMC  3788059. PMID  23856191.
• Saier, Milton H.; Reddy, Bhaskara L. (1 de enero de 2015). "Holinas en bacterias, eucariotas y arqueas: xenólogos multifuncionales con posibles aplicaciones biotecnológicas y biomédicas". Journal of Bacteriology 197 (1): 7–17. doi :10.1128/JB.02046-14. ISSN  0021-9193. PMC  4288690. PMID  25157079.
• Wang, IN; Smith, DL; Young, R. (1 de enero de 2000). "Holinas: los relojes proteicos de las infecciones por bacteriófagos". Revisión anual de microbiología 54 : 799–825. doi :10.1146/annurev.micro.54.1.799. ISSN  0066-4227. PMID  11018145.

Referencias

1. "Superfamilia Holin II". TCDB . Consultado el 4 de abril de 2016 .
2. "1.E.50. La familia de las holinas β-proteobacterianas (BP-Hol)". TCDB . Consultado el 29 de marzo de 2016 .

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