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Familia de glucósido hidrolasa 67

En biología molecular, la familia de glucósido hidrolasa 67 es una familia de glucósido hidrolasas .

Glucósido hidrolasas EC 3.2.1. son un grupo muy extendido de enzimas que hidrolizan el enlace glicosídico entre dos o más carbohidratos, o entre un carbohidrato y un resto no carbohidrato. Un sistema de clasificación de las glucósido hidrolasas, basado en la similitud de secuencia, ha llevado a la definición de más de 100 familias diferentes. [1] [2] [3] Esta clasificación está disponible en el sitio web de CAZy , [4] [5] y también se analiza en CAZypedia, una enciclopedia en línea de enzimas activas de carbohidratos. [6] [7]

La familia 67 de glucósido hidrolasa incluye alfa-glucuronidasas , que son componentes de un conjunto de enzimas fundamentales para el reciclaje de la biomasa fotosintética y eliminan el ácido 4-O-metilglucurónico unido alfa-1,2 de los xilanos .

Los miembros de esta familia constan de tres dominios estructurales. Los mutantes por deleción de la alfa-glucuronidasa de Bacillus stearothermophilus han indicado que la región central es responsable de la actividad catalítica . Dentro de este dominio central, se cree que los invariantes Glu y Asp (residuos 391 y 364 respectivamente de Bacillus stearothermophilus ) forman el centro catalítico. [8] La región C-terminal de la alfa-glucuronidasa es principalmente alfa-helicoidal . Envuelve el dominio catalítico , realizando interacciones adicionales tanto con el dominio N-terminal de su monómero original como formando también la mayor parte de la superficie del dímero con el dominio C-terminal equivalente del otro monómero del dímero . [9]

Referencias

  1. ^ Henrissat B, Callebaut I, Fábrega S, Lehn P, Mornon JP, Davies G (julio de 1995). "Maquinaria catalítica conservada y predicción de un pliegue común para varias familias de glicosilhidrolasas". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 92 (15): 7090–4. Código bibliográfico : 1995PNAS...92.7090H. doi : 10.1073/pnas.92.15.7090 . PMC  41477 . PMID  7624375.
  2. ^ Davies G, Henrissat B (septiembre de 1995). "Estructuras y mecanismos de las glicosilhidrolasas". Estructura . 3 (9): 853–9. doi : 10.1016/S0969-2126(01)00220-9 . PMID  8535779.
  3. ^ Henrissat B, Bairoch A (junio de 1996). "Actualización de la clasificación basada en secuencias de glicosilhidrolasas". La revista bioquímica . 316 (Parte 2) (Parte 2): 695–6. doi :10.1042/bj3160695. PMC 1217404 . PMID  8687420. 
  4. ^ "Inicio". CAZy.org . Consultado el 6 de marzo de 2018 .
  5. ^ Lombard V, Golaconda Ramulu H, Drula E, Coutinho PM, Henrissat B (enero de 2014). "La base de datos de enzimas activas sobre carbohidratos (CAZy) en 2013". Investigación de ácidos nucleicos . 42 (Problema de la base de datos): D490–5. doi : 10.1093/nar/gkt1178. PMC 3965031 . PMID  24270786. 
  6. ^ "Familia 67 de glucósido hidrolasa". CAZypedia.org . Consultado el 6 de marzo de 2018 .
  7. ^ Consorcio CAZypedia (diciembre de 2018). "Diez años de CAZypedia: una enciclopedia viviente de enzimas activas en carbohidratos" (PDF) . Glicobiología . 28 (1): 3–8. doi : 10.1093/glicob/cwx089 . hdl :21.11116/0000-0003-B7EB-6. PMID  29040563.
  8. ^ Shoham Y, Zaide G, Shallom D, Shulami S, Zolotnitsky G, Golan G, Baasov T, Shoham G (2001). "Caracterización bioquímica e identificación de residuos catalíticos en alfa-glucuronidasa de Bacillus stearothermophilus T-6". EUR. J. Bioquímica . 268 (10): 3006–3016. doi : 10.1046/j.1432-1327.2001.02193.x . PMID  11358519.
  9. ^ Nurizzo D, Nagy T, Gilbert HJ, Davies GJ (abril de 2002). "La base estructural de la catálisis y especificidad de la alfa-glucuronidasa de Pseudomonas cellulosa, GlcA67A". Estructura . 10 (4): 547–56. doi : 10.1016/s0969-2126(02)00742-6 . PMID  11937059.
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