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Familia de glucósido hidrolasa 6

En biología molecular, la familia 6 de glucósido hidrolasa es una familia de glucósido hidrolasas EC 3.2.1., que son un grupo muy extendido de enzimas que hidrolizan el enlace glicosídico entre dos o más carbohidratos, o entre un carbohidrato y un resto no carbohidrato. Un sistema de clasificación de las glucósido hidrolasas, basado en la similitud de secuencia, ha llevado a la definición de más de 100 familias diferentes. [1] [2] [3] Esta clasificación está disponible en el sitio web de CAZy , [4] [5] y también se analiza en CAZypedia, una enciclopedia en línea de enzimas activas de carbohidratos. [6] [7]

La familia 6 de glucósido hidrolasa CAZY GH_6 comprende enzimas con varias actividades conocidas, incluida la endoglucanasa ( EC 3.2.1.4) y la celobiohidrolasa ( EC 3.2.1.91). Estas enzimas se conocían anteriormente como familia de celulasas B. La estructura tridimensional del núcleo enzimático de la celobiohidrolasa II (CBHII) del hongo Trichoderma reesei revela una proteína alfa-beta con un pliegue similar a la ubicua topología de barril observada por primera vez en la triosa fosfato isomerasa . [8] El sitio activo de CBHII está ubicado en el extremo C-terminal de un barril beta paralelo, en un túnel cerrado a través del cual pasa la celulosa . Dos residuos de ácido aspártico , ubicados en el centro del túnel, son los probables residuos catalíticos. [8]

Referencias

  1. ^ Henrissat B, Callebaut I, Fábrega S, Lehn P, Mornon JP, Davies G (julio de 1995). "Maquinaria catalítica conservada y predicción de un pliegue común para varias familias de glicosilhidrolasas". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 92 (15): 7090–4. Código bibliográfico : 1995PNAS...92.7090H. doi : 10.1073/pnas.92.15.7090 . PMC  41477 . PMID  7624375.
  2. ^ Davies G, Henrissat B (septiembre de 1995). "Estructuras y mecanismos de las glicosilhidrolasas". Estructura . 3 (9): 853–9. doi : 10.1016/S0969-2126(01)00220-9 . PMID  8535779.
  3. ^ Henrissat B, Bairoch A (junio de 1996). "Actualización de la clasificación basada en secuencias de glicosilhidrolasas". La revista bioquímica . 316 (parte 2): 695–6. doi :10.1042/bj3160695. PMC 1217404 . PMID  8687420. 
  4. ^ "Inicio". CAZy.org . Consultado el 6 de marzo de 2018 .
  5. ^ Lombard V, Golaconda Ramulu H, Drula E, Coutinho PM, Henrissat B (enero de 2014). "La base de datos de enzimas activas sobre carbohidratos (CAZy) en 2013". Investigación de ácidos nucleicos . 42 (Problema de la base de datos): D490–5. doi : 10.1093/nar/gkt1178. PMC 3965031 . PMID  24270786. 
  6. ^ "Familia 6 de glucósido hidrolasa". CAZypedia.org . Consultado el 6 de marzo de 2018 .
  7. ^ Consorcio CAZypedia (diciembre de 2018). "Diez años de CAZypedia: una enciclopedia viviente de enzimas activas sobre carbohidratos". Glicobiología . 28 (1): 3–8. doi : 10.1093/glicob/cwx089 . hdl : 21.11116/0000-0003-B7EB-6 . PMID  29040563.
  8. ^ ab Rouvinen J, Bergfors T, Teeri T, Knowles JK, Jones TA (julio de 1990). "Estructura tridimensional de la celobiohidrolasa II de Trichoderma reesei". Ciencia . 249 (4967): 380–6. Código Bib : 1990 Ciencia... 249.. 380R. doi : 10.1126/ciencia.2377893. PMID  2377893.