Familia de glucósido hidrolasa 43

En biología molecular, la familia 43 de las glucósido hidrolasas es una familia de glucósidos hidrolasas .

Glucósido hidrolasas EC 3.2.1. son un grupo muy extendido de enzimas que hidrolizan el enlace glicosídico entre dos o más carbohidratos, o entre un carbohidrato y un resto no carbohidrato. Un sistema de clasificación de las glucósido hidrolasas, basado en la similitud de secuencia, ha llevado a la definición de más de 100 familias diferentes. ^{[1] [2] [3]} Esta clasificación está disponible en el sitio web de CAZy , ^{[4] [5]} y también se analiza en CAZypedia, una enciclopedia en línea de enzimas activas de carbohidratos. ^{[6] [7]}

La familia de glucósido hidrolasa 43 CAZY GH_43 incluye enzimas con las siguientes actividades, beta-xilosidasa ( EC 3.2.1.37), alfa-L-arabinofuranosidasa ( EC 3.2.1.55); arabinanasa ( EC 3.2.1.99) y xilanasa ( EC 3.2.1.8). La estructura de la arabinanasa Arb43A de Cellvibrio japonicus revela un pliegue en hélice beta de cinco palas. Una larga ranura en forma de V, parcialmente cerrada en un extremo, forma una única superficie de unión de sustrato extendida a lo largo de la cara de la hélice. ^[8]

Referencias

1. Henrissat B, Callebaut I, Fábrega S, Lehn P, Mornon JP, Davies G (julio de 1995). "Maquinaria catalítica conservada y predicción de un pliegue común para varias familias de glicosilhidrolasas". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 92 (15): 7090–4. Código bibliográfico : 1995PNAS...92.7090H. doi : 10.1073/pnas.92.15.7090 . PMC  41477 . PMID  7624375.
2. Davies G, Henrissat B (septiembre de 1995). "Estructuras y mecanismos de las glicosilhidrolasas". Estructura . 3 (9): 853–9. doi : 10.1016/S0969-2126(01)00220-9 . PMID  8535779.
3. Henrissat B, Bairoch A (junio de 1996). "Actualización de la clasificación basada en secuencias de glicosilhidrolasas". La revista bioquímica . 316 (parte 2): 695–6. doi :10.1042/bj3160695. PMC 1217404 . PMID  8687420. 
4. "Inicio". CAZy.org . Consultado el 6 de marzo de 2018 .
5. Lombard V, Golaconda Ramulu H, Drula E, Coutinho PM, Henrissat B (enero de 2014). "La base de datos de enzimas activas sobre carbohidratos (CAZy) en 2013". Investigación de ácidos nucleicos . 42 (Problema de base de datos): D490-5. doi : 10.1093/nar/gkt1178. PMC 3965031 . PMID  24270786. 
6. "Familia 43 de glucósido hidrolasa". CAZypedia.org . Consultado el 6 de marzo de 2018 .
7. Consorcio CAZypedia (diciembre de 2018). "Diez años de CAZypedia: una enciclopedia viviente de enzimas activas sobre carbohidratos". Glicobiología . 28 (1): 3–8. doi : 10.1093/glicob/cwx089 . hdl : 21.11116/0000-0003-B7EB-6 . PMID  29040563.
8. Nurizzo D, Turkenburg JP, Charnock SJ, Roberts SM, Dodson EJ, McKie VA, Taylor EJ, Gilbert HJ, Davies GJ (septiembre de 2002). "Cellvibrio japonicus alfa-L-arabinanasa 43A tiene un novedoso pliegue de hélice beta de cinco palas". Biología estructural de la naturaleza . 9 (9): 665–8. doi :10.1038/nsb835. PMID  12198486. S2CID  19677477.

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