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Familia de glucósido hidrolasa 25

En biología molecular, la familia 25 de glucósido hidrolasa es una familia de glucósido hidrolasas .

Glucósido hidrolasas EC 3.2.1. son un grupo muy extendido de enzimas que hidrolizan el enlace glicosídico entre dos o más carbohidratos, o entre un carbohidrato y un resto no carbohidrato. Un sistema de clasificación de las glucósido hidrolasas, basado en la similitud de secuencia, ha llevado a la definición de más de 100 familias diferentes. [1] [2] [3] Esta clasificación está disponible en el sitio web de CAZy , [4] [5] y también se analiza en CAZypedia, una enciclopedia en línea de enzimas activas de carbohidratos. [6] [7]

La familia de glucósido hidrolasa 25 CAZY GH_25 comprende enzimas con una sola actividad conocida; lisozima ( EC 3.2.1.17). Se ha demostrado [8] [9] que varias enzimas líticas de la pared celular están relacionadas evolutivamente y pueden clasificarse en una sola familia. Se ha demostrado que dos residuos, un aspartato y un glutamato [10] , son importantes para la actividad catalítica de la enzima Charalopsis . Estos residuos, así como algunos otros cercanos, se conservan en todas las proteínas de esta familia.

Referencias

  1. ^ Henrissat B, Callebaut I, Fábrega S, Lehn P, Mornon JP, Davies G (julio de 1995). "Maquinaria catalítica conservada y predicción de un pliegue común para varias familias de glicosilhidrolasas". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 92 (15): 7090–4. Código bibliográfico : 1995PNAS...92.7090H. doi : 10.1073/pnas.92.15.7090 . PMC  41477 . PMID  7624375.
  2. ^ Davies G, Henrissat B (septiembre de 1995). "Estructuras y mecanismos de las glicosilhidrolasas". Estructura . 3 (9): 853–9. doi : 10.1016/S0969-2126(01)00220-9 . PMID  8535779.
  3. ^ Henrissat B, Bairoch A (junio de 1996). "Actualización de la clasificación basada en secuencias de glicosilhidrolasas". La revista bioquímica . 316 (parte 2): 695–6. doi :10.1042/bj3160695. PMC 1217404 . PMID  8687420. 
  4. ^ "Inicio". CAZy.org . Consultado el 6 de marzo de 2018 .
  5. ^ Lombard V, Golaconda Ramulu H, Drula E, Coutinho PM, Henrissat B (enero de 2014). "La base de datos de enzimas activas sobre carbohidratos (CAZy) en 2013". Investigación de ácidos nucleicos . 42 (Problema de base de datos): D490-5. doi : 10.1093/nar/gkt1178. PMC 3965031 . PMID  24270786. 
  6. ^ "Familia de glucósido hidrolasa 25". CAZypedia.org . Consultado el 6 de marzo de 2018 .
  7. ^ Consorcio CAZypedia (diciembre de 2018). "Diez años de CAZypedia: una enciclopedia viviente de enzimas activas en carbohidratos" (PDF) . Glicobiología . 28 (1): 3–8. doi : 10.1093/glicob/cwx089 . PMID  29040563.
  8. ^ Henrissat B (diciembre de 1991). "Una clasificación de glicosilhidrolasas basada en similitudes de secuencia de aminoácidos". La revista bioquímica . 280 (2): 309–16. doi :10.1042/bj2800309. PMC 1130547 . PMID  1747104. 
  9. ^ Croux C, García JL (julio de 1991). "Secuencia del gen lyc que codifica la lisozima autolítica de Clostridium acetobutylicum ATCC824: comparación con otras enzimas líticas". Gen.104 (1): 25–31. doi :10.1016/0378-1119(91)90460-S. PMID  1916274.
  10. ^ Fouché PB, Hash JH (octubre de 1978). "La N, O-diacetilmuramidasa de las especies de Chalaropsis. Identificación de residuos de aspartilo y glutamilo en el sitio activo". La Revista de Química Biológica . 253 (19): 6787–93. doi : 10.1016/S0021-9258(17)37988-7 . PMID  567645.
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