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Familia de glucósido hidrolasa 19

En biología molecular, la familia de glucósido hidrolasa 19 es una familia de glucósido hidrolasas EC 3.2.1., que son un grupo muy extendido de enzimas que hidrolizan el enlace glicosídico entre dos o más carbohidratos, o entre un carbohidrato y un resto no carbohidrato. Un sistema de clasificación de las glucósido hidrolasas, basado en la similitud de secuencia, ha llevado a la definición de más de 100 familias diferentes. [1] [2] [3] Esta clasificación está disponible en el sitio web de CAZy , [4] [5] y también se analiza en CAZypedia, una enciclopedia en línea de enzimas activas de carbohidratos. [6] [7] y[_]9

La familia de glucósido hidrolasa 19 CAZY GH_19 comprende enzimas con una sola actividad conocida; quitinasa ( EC 3.2.1.14).

Las quitinasas [8] son ​​enzimas que catalizan la hidrólisis de los enlaces beta-1,4-N-acetil-D-glucosamina en los polímeros de quitina. Las quitinasas pertenecen a las familias de glucósidos hidrolasas 18 o 19. [9] Las quitinasas de la familia 19 (también conocidas como clases IA o I y IB o II) son enzimas de plantas que funcionan en la defensa contra hongos e insectos patógenos al destruir sus enzimas que contienen quitina. pared celular . Las enzimas de clase IA/I y IB/II se diferencian por la presencia (IA/I) o ausencia (IB/II) de un dominio de unión a quitina N-terminal. El dominio catalítico de estas enzimas consta de aproximadamente 220 a 230 residuos de aminoácidos.

Sitio activo

Sitio activo de la quitinasa de papaya de la familia 19 de la glucósido hidrolasa ( PDB : 3cql ​) . [10] Se muestran residuos conservados que rodean el ácido catalítico, Glu67. Una unidad GlcNAc2 que se une a los subsitios -1 y +1 se muestra en una representación de barra estrecha y una flecha indica la posición del oxígeno glicosídico.

Las enzimas GH19 tienen un motivo de secuencia conservada ([FHY]-GRG-[AP]-ζ-Q-[IL]-[ST]-[FHYW]-[HN]-[FY]-[NY], ζ= amino hidrófilo ácido) en su sitio activo. [11]

Referencias

  1. ^ Henrissat B, Callebaut I, Fábrega S, Lehn P, Mornon JP, Davies G (julio de 1995). "Maquinaria catalítica conservada y predicción de un pliegue común para varias familias de glicosilhidrolasas". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 92 (15): 7090–4. Código bibliográfico : 1995PNAS...92.7090H. doi : 10.1073/pnas.92.15.7090 . PMC  41477 . PMID  7624375.
  2. ^ Davies G, Henrissat B (septiembre de 1995). "Estructuras y mecanismos de las glicosilhidrolasas". Estructura . 3 (9): 853–9. doi : 10.1016/S0969-2126(01)00220-9 . PMID  8535779.
  3. ^ Henrissat B, Bairoch A (junio de 1996). "Actualización de la clasificación basada en secuencias de glicosilhidrolasas". La revista bioquímica . 316 (Parte 2) (Parte 2): 695–6. doi :10.1042/bj3160695. PMC 1217404 . PMID  8687420. 
  4. ^ "Inicio". CAZy.org . Consultado el 6 de marzo de 2018 .
  5. ^ Lombard V, Golaconda Ramulu H, Drula E, Coutinho PM, Henrissat B (enero de 2014). "La base de datos de enzimas activas sobre carbohidratos (CAZy) en 2013". Investigación de ácidos nucleicos . 42 (Problema de base de datos): D490-5. doi : 10.1093/nar/gkt1178. PMC 3965031 . PMID  24270786. 
  6. ^ "Familia 19 de glucósido hidrolasa". CAZypedia.org . Consultado el 6 de marzo de 2018 .
  7. ^ Consorcio CAZypedia (diciembre de 2018). "Diez años de CAZypedia: una enciclopedia viviente de enzimas activas en carbohidratos" (PDF) . Glicobiología . 28 (1): 3–8. doi : 10.1093/glicob/cwx089 . PMID  29040563.
  8. ^ Flach J, Pilet PE, Jollès P (agosto de 1992). "¿Qué hay de nuevo en la investigación de la quitinasa?". Experiencia . 48 (8): 701–16. doi :10.1007/BF02124285. PMID  1516675. S2CID  37362071.
  9. ^ Henrissat B (diciembre de 1991). "Una clasificación de glicosilhidrolasas basada en similitudes de secuencia de aminoácidos". La revista bioquímica . 280 (Parte 2) (2): 309–16. doi :10.1042/bj2800309. PMC 1130547 . PMID  1747104. 
  10. ^ Eijsink V, Hoell I, Vaaje-Kolstada G (1 de enero de 2010). "Estructura y función de enzimas que actúan sobre quitina y quitosano". Reseñas de biotecnología e ingeniería genética . 27 (1): 331–66. doi : 10.1080/02648725.2010.10648156 . PMID  21415904.
  11. ^ Udaya Prakash NA, Jayanthi M, Sabarinathan R, Kangueane P, Mathew L, Sekar K (mayo de 2010). "Evolución, conservación de la homología e identificación de firmas de secuencia únicas en quitinasas de la familia GH19". Revista de evolución molecular . 70 (5): 466–78. Código Bib : 2010JMolE..70..466U. doi :10.1007/s00239-010-9345-z. PMID  20480157. S2CID  2202745.
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