Familia de glucósido hidrolasa 108

En biología molecular, la familia glucósido hidrolasa 108 es una familia de glucósido hidrolasas .

Glucósido hidrolasas EC 3.2.1. son un grupo muy extendido de enzimas que hidrolizan el enlace glicosídico entre dos o más carbohidratos, o entre un carbohidrato y un resto no carbohidrato. Un sistema de clasificación de las glucósido hidrolasas, basado en la similitud de secuencia, ha llevado a la definición de más de 100 familias diferentes. ^{[1] [2] [3]} Esta clasificación está disponible en el sitio web de CAZy , ^{[4] [5]} y también se analiza en CAZypedia, una enciclopedia en línea de enzimas activas de carbohidratos. ^{[6] [7]}

La familia de glucósido hidrolasa 108 CAZY GH_108 incluye enzimas con actividad lisozima (N-acetilmuramidasa) EC 3.2.1.17. Un residuo de ácido glutámico dentro de un motivo Glu - Gly -Gly- Tyr conservado es esencial para la actividad catalítica . ^[8] En las bacterias, puede activar la secreción de proteínas grandes mediante la ruptura y reordenamiento de la capa de peptidoglicano durante la secreción. ^{[9] [10]}

Referencias

1. Henrissat B, Callebaut I, Fábrega S, Lehn P, Mornon JP, Davies G (julio de 1995). "Maquinaria catalítica conservada y predicción de un pliegue común para varias familias de glicosilhidrolasas". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 92 (15): 7090–4. Código bibliográfico : 1995PNAS...92.7090H. doi : 10.1073/pnas.92.15.7090 . PMC  41477 . PMID  7624375.
2. Davies G, Henrissat B (septiembre de 1995). "Estructuras y mecanismos de las glicosilhidrolasas". Estructura . 3 (9): 853–9. doi : 10.1016/S0969-2126(01)00220-9 . PMID  8535779.
3. Henrissat B, Bairoch A (junio de 1996). "Actualización de la clasificación basada en secuencias de glicosilhidrolasas". La revista bioquímica . 316 (parte 2): 695–6. doi :10.1042/bj3160695. PMC 1217404 . PMID  8687420. 
4. "Inicio". CAZy.org . Consultado el 6 de marzo de 2018 .
5. Lombard V, Golaconda Ramulu H, Drula E, Coutinho PM, Henrissat B (enero de 2014). "La base de datos de enzimas activas sobre carbohidratos (CAZy) en 2013". Investigación de ácidos nucleicos . 42 (Problema de la base de datos): D490–5. doi : 10.1093/nar/gkt1178. PMC 3965031 . PMID  24270786. 
6. "Familia glucósido hidrolasa 108". CAZypedia.org . Consultado el 6 de marzo de 2018 .
7. Consorcio CAZypedia (diciembre de 2018). "Diez años de CAZypedia: una enciclopedia viviente de enzimas activas en carbohidratos" (PDF) . Glicobiología . 28 (1): 3–8. doi : 10.1093/glicob/cwx089 . PMID  29040563.
8. Stojković EA, Rothman-Denes LB (2007). "La N-acetilmuramidasa Coliphage N4 define una nueva familia de mureína hidrolasas". J Mol Biol . 366 (2): 406–19. doi :10.1016/j.jmb.2006.11.028. PMID  17174325.
9. Pei J, Grishin NV (2005). "COG3926 y COG5526: una historia de dos nuevas familias de proteínas similares a lisozimas". Ciencia de las proteínas . 14 (10): 2574–81. doi : 10.1110/ps.051656805. PMC 2253296 . PMID  16155206. 
10. Kondo Y, Toyoda A, Fukushi H, Yanase H, Tonomura K, Kawasaki H, et al. (1994). "Clonación y caracterización de un par de genes que estimulan la producción y secreción de levansucrasa e invertasa extracelular de Zymomonas mobilis". Biosci Biotechnol Biochem . 58 (3): 526–30. doi : 10.1271/bbb.58.526 . PMID  7764692.