La Eurocopa FIBA 2005-06 fue la tercera temporada de la Eurocopa FIBA , la tercera competición de baloncesto de clubes más importante de Europa. Fue la primera temporada de la competición bajo el nuevo nombre de Eurocopa , que ahora se utiliza para la antigua Copa ULEB . Un total de 32 equipos de 20 países participaron en la competición. La temporada finalizó con la Final Four de la Eurocopa, que se celebró en Kiev , Ucrania . El Joventut Badalona ganó la copa tras derrotar al BC Khimki por 88-63 en la final.
Un total de 32 equipos se dividieron en 8 grupos de cuatro equipos cada uno. Los dos primeros equipos de cada grupo avanzaron a la siguiente fase, donde se dividieron en cuatro nuevos grupos de cuatro. Los dos primeros equipos de cada grupo en la segunda fase de grupos avanzaron a los cuartos de final, que se jugaron con un sistema de playoffs al mejor de tres . El ganador de cada serie avanzó a la Final Four de la Eurocopa 2006, que se celebró en Kiev .
El número de equipos se mantuvo en 32, de los cuales 7 fueron campeones nacionales (incluido Croacia) y 4 subcampeones, incluidos Francia e Israel.