La Esiliiga 1996-97 es la sexta temporada de la Esiliiga , la segunda liga más importante de Estonia para clubes de fútbol , desde su creación en 1992.
Jugado en otoño de 1996.
Los cuatro mejores equipos se clasifican para el play-off de ascenso a la Premier Division y los otros cuatro para el play-off de ascenso a la Primera División.
Jugado en la primavera de 1997.
Ninguno de los cuatro equipos logró terminar por encima de los dos equipos de la Premier Division, por lo que todos permanecerán en Primera División para la próxima temporada.
Jugado en la primavera de 1997.
JK Merkuur Tartu y JK Dokker Tallinn ascendieron de Segunda División, mientras que JK Tulevik Viljandi y FC Norma Tallinn descendieron.