Epi abierto

OpenEpi es una serie de programas gratuitos , basados ​​en la web, de código abierto e independientes del sistema operativo para su uso en epidemiología , bioestadística , salud pública y medicina , que proporciona una serie de herramientas epidemiológicas y estadísticas para datos resumidos. ^{[1] [2] [3] [4] [5] [6] [7] [8] [9] [10 ] [11]} OpenEpi se desarrolló en JavaScript y HTML , y se puede ejecutar en navegadores web modernos . El programa se puede ejecutar desde el sitio web de OpenEpi o descargar y ejecutar sin una conexión web. El código fuente y la documentación se pueden descargar y están disponibles de forma gratuita para que los utilicen otros investigadores. OpenEpi ha sido revisado, tanto por organizaciones de medios como en revistas de investigación. ^{[12] [13] [14] [15] [16]}

Los desarrolladores de OpenEpi tienen una amplia experiencia en el desarrollo y prueba de Epi Info , un programa desarrollado por los Centros para el Control y la Prevención de Enfermedades (CDC) y ampliamente utilizado en todo el mundo para la entrada y el análisis de datos. OpenEpi fue desarrollado para realizar análisis que se encuentran en la versión DOS de los módulos StatCalc y EpiTable de Epi Info , para mejorar los tipos de análisis proporcionados por estos módulos y para proporcionar una serie de herramientas y cálculos que actualmente no están disponibles en Epi Info. Es el primer paso hacia un conjunto de herramientas de software epidemiológico completamente basado en la web. OpenEpi puede considerarse un complemento importante para Epi Info y otros programas como SAS , PSPP , SPSS , Stata , SYSTAT , Minitab , Epidata y R (consulte el lenguaje de programación R ). Otro programa basado en Windows funcionalmente similar es Winpepi . Consulte también la lista de paquetes estadísticos y la comparación de paquetes estadísticos . Tanto OpenEpi como Epi Info se desarrollaron con el objetivo de proporcionar herramientas para áreas del mundo con recursos bajos y moderados. El desarrollo inicial de OpenEpi fue apoyado por una subvención de la Fundación Bill y Melinda Gates a la Universidad Emory . ^[17]

Tipos

Los tipos de cálculos que actualmente realiza OpenEpi incluyen:

• Varios intervalos de confianza para proporciones, tasas, razón de mortalidad estandarizada , media , mediana y percentiles.
• Tablas crudas y estratificadas 2x2 para datos de recuento y tasa
• Análisis de casos y controles emparejados
• Prueba de tendencia con datos de recuento
• Prueba t independiente y ANOVA unidireccional
• Análisis de pruebas diagnósticas y de detección con curvas ROC ( receptor operating characteristic )
• Tamaño de muestra para proporciones, encuestas transversales , casos y controles no emparejados , cohortes , ensayos controlados aleatorios y comparación de dos medias
• Cálculos de potencia para proporciones ( casos y controles no emparejados , transversales , de cohorte, ensayos controlados aleatorios ) y para la comparación de dos medias
• Generador de números aleatorios

Para los epidemiólogos y otros investigadores de la salud, OpenEpi realiza una serie de cálculos basados ​​en tablas que no se encuentran en la mayoría de los paquetes epidemiológicos y estadísticos. Por ejemplo, para una sola tabla 2x2, además de los resultados presentados en otros programas, OpenEpi proporciona estimaciones para:

• Fracción etiológica o prevenible en la población y en la población expuesta con intervalos de confianza, basados ​​en datos de riesgo, probabilidades o tasas
• Estimación del ratio de probabilidades del producto cruzado y MLE
• Valores p exactos de mediana p y límites de confianza para la razón de probabilidades
• Cálculos de razones de tasas y diferencias de tasas con intervalos de confianza y pruebas estadísticas.

Para tablas estratificadas 2x2 con datos de recuento, OpenEpi proporciona:

• Estimaciones basadas en precisión y Mantel-Haenszel (MH) de la razón de riesgos y la razón de probabilidades
• Diferencia de riesgo ajustada basada en precisión
• Pruebas de interacción para el riesgo relativo , el odds ratio y la diferencia de riesgo
• Cuatro métodos diferentes de límite de confianza para la razón de probabilidades.

De manera similar a Epi Info, en un análisis estratificado se proporcionan estimaciones tanto brutas como ajustadas para que se pueda realizar la evaluación de los factores de confusión . Con los datos de tasa, OpenEpi proporciona razones de tasa ajustadas y diferencias de tasa, y realiza pruebas de interacción . Por último, con los datos de recuento, OpenEpi también realiza una prueba de tendencia, tanto para los datos brutos como para los estratificados.

Además de ser utilizado para analizar datos por investigadores de la salud, OpenEpi se ha utilizado como herramienta de formación para enseñar epidemiología a estudiantes de: Emory University , University of Massachusetts , University of Michigan , University of Minnesota , Morehouse College , Columbia University , University of Wisconsin , San Jose State University , University of Medicine and Dentistry of New Jersey , University of Washington y otros lugares. Esto incluye cursos presenciales y a distancia. Debido a que OpenEpi es fácil de usar, no requiere experiencia en programación y se puede ejecutar en Internet, los estudiantes pueden usar el programa y centrarse en la interpretación de los resultados. Los usuarios pueden ejecutar el programa en inglés, francés, español, portugués o italiano.

Los comentarios y sugerencias para realizar mejoras son bienvenidos y los desarrolladores responden a las consultas de los usuarios. Los desarrolladores alientan a otros a desarrollar módulos que se puedan agregar a OpenEpi y proporcionan una herramienta para desarrolladores en el sitio web. Los desarrollos futuros planificados incluyen mejoras en los módulos existentes, desarrollo de nuevos módulos, traducción a otros idiomas y la posibilidad de cortar y pegar datos y/o leer archivos de datos.

Véase también

• Portal de software libre y de código abierto

• Software estadístico gratuito
• Simulación basada en web

Referencias

1. Sullivan KM, Dean A, Soe MM (2009). "OpenEpi: una calculadora epidemiológica y estadística basada en la web para la salud pública". Public Health Reports . 124 (3): 471–474. doi :10.1177/003335490912400320. PMC  2663701 . PMID  19445426.
2. Sullivan K.; Abramson J. (julio de 2008). "Actualización sobre software epidemiológico gratuito". The Epidemiology Monitor . 29 (7): 3–4.
3. Sullivan, K. (primavera-verano de 2008). "Faculty Spotlight". The Epi Vanguard .
4. Sullivan, KM (diciembre de 2007). "OpenEpi ahora disponible en inglés, francés, italiano y español". The Epidemiology Monitor . 28 (14).
5. Sullivan KM, Dean A, Soe MM (mayo de 2007). "OpenEpi versión 2". The Epidemiology Monitor . 28 (5): 1, 9–10.
6. Sullivan, KM (abril de 2007). "Descripción general del software analítico gratuito para epidemiólogos". The Epidemiology Monitor . 28 (4).
7. Sullivan, KM (primavera de 2007). "OpenEpi: una calculadora basada en la web". The Epi Vanguard .
8. Sullivan K, Dean A, Soe MM (junio de 2006). "OpenEpi: una actualización". The Epidemiology Monitor . 27 (6): 4.
9. Sullivan KM, Dean AG, Mir R (abril de 2004). "OpenEpi: un nuevo esfuerzo colaborativo en informática epidemiológica". The Epidemiology Monitor . 25 (4): 3, 7, 9.
10. Sullivan KM, Dean AG, Mir R (11–14 de junio de 2003). OpenEpi: un nuevo esfuerzo colaborativo en informática epidemiológica . 36.ª Reunión Anual de la Sociedad de Investigación Epidemiológica. Atlanta, GA , Estados Unidos.
11. Dean AG, Sullivan KM, Mir R (1–4 de octubre de 2003). Iniciativa Open Epi: software de navegador web de código abierto para la salud pública . Reunión científica anual de la Asociación Internacional de Epidemiología. Toledo, España : Federación Europea de Epidemiología.
12. "OpenEpi en línea". 24 de septiembre de 2007.
13. Excelentes herramientas gratuitas para enseñar estadística | Informática educativa | ZDNet.com
14. Antoch, J. (2008). "Entorno para computación estadística". Computer Science Review . 2 (2): 113–122. doi :10.1016/j.cosrev.2008.05.002.
15. Abramson JH, Abramson ZH (2008). Métodos de investigación en medicina comunitaria: encuestas, investigación epidemiológica, evaluación de programas, ensayos clínicos (6.ª ed.). John Wiley & Sons.
16. Singh, S. (2009). "Revisión de software gratuito de entrada y análisis de epidatos". Indian Journal of Community Medicine . 34 (34): 76–7. doi : 10.4103/0970-0218.45384 . PMC 2763648 . PMID  19876466. 
17. "Copia archivada" (PDF) . Archivado desde el original (PDF) el 20 de septiembre de 2009. Consultado el 22 de septiembre de 2009 .{{cite web}}: CS1 maint: copia archivada como título ( enlace )

Enlaces externos

• Sitio web oficial