Esta es una lista de puertos y bahías en Estonia . El artículo se divide entre puertos que brindan servicios independientemente del tamaño del buque y puertos que tienen restricciones sobre el tamaño del buque o que no brindan ningún servicio (puerto menor, väikesadam ).
Los puertos que no prestan servicio a buques extranjeros están marcados con un asterisco.*
Los puertos que sólo prestan servicio a buques en tareas administrativas estatales están en cursiva.