El estudio de los virus antiguos
La paleovirología es el estudio de los virus que existieron en el pasado pero que ahora están extintos. En general, los virus no pueden dejar fósiles físicos, [1] por lo tanto, se utilizan pruebas indirectas para reconstruir el pasado. Por ejemplo, los virus pueden causar la evolución de sus huéspedes, y las firmas de esa evolución se pueden encontrar e interpretar en la actualidad. [2] Además, algunos fragmentos genéticos virales que se integraron en las células de la línea germinal de un organismo antiguo se han transmitido hasta nuestro tiempo como fósiles virales , [2] o elementos virales endógenos (EVE). [3] Los EVE que se originan a partir de la integración de retrovirus se conocen como retrovirus endógenos o ERV, [4] y la mayoría de los fósiles virales son ERV. Pueden preservar el código genético de hace millones de años, de ahí la terminología "fósil", aunque nadie ha detectado un virus en fósiles minerales . [2] Los fósiles virales más sorprendentes se originan a partir de virus de ADN y ARN no retrovirales .
Terminología
Aunque no existe un sistema de clasificación formal para los EVEs, se los clasifica según la taxonomía de su origen viral. De hecho, todos los tipos de genoma viral conocidos y las estrategias de replicación, según lo define la clasificación de Baltimore , se han encontrado en el registro fósil genómico. [5] [6] Se han designado acrónimos para describir diferentes tipos de fósiles virales.
- EVE: Elemento viral endógeno
- ERV: Retrovirus endógeno
- HERV: Retrovirus endógeno humano
- NIRV: Los fósiles virales originados a partir de virus ARN no retrovirales se han denominado virus ARN integrados no retrovirales o NIRV. [7] [8] A diferencia de otros tipos de fósiles virales, la formación de NIRV requiere tomar prestada la maquinaria de integración que está codificada por el genoma del huésped o por un retrovirus coinfectante. [9]
Otros fósiles virales se originan a partir de virus de ADN como los hepadnavirus (un grupo que incluye la hepatitis B ). [10]
Resurrección
Se han reportado intentos exitosos de "resucitar" virus extintos a partir de fósiles de ADN. [11] Además, el Pithovirus sibericum fue revivido a partir de un núcleo de hielo de 30.000 años de antigüedad extraído del permafrost en Siberia , Rusia. [12] [13]
Véase también
Referencias
- ^ Laidler, JR; Stedman, KM (2010). "Silicificación de virus en condiciones simuladas de aguas termales". Astrobiología . 10 (6): 569–576. Código Bibliográfico :2010AsBio..10..569L. doi :10.1089/ast.2010.0463. PMID 20735248. S2CID 7274625.
- ^ abc Emerman, M.; Malik, HS (2010). "Paleovirología: consecuencias modernas de virus antiguos". PLOS Biology . 8 (2): e1000301. doi : 10.1371/journal.pbio.1000301 . PMC 2817711 . PMID 20161719.
- ^ Katzourakis, Aris; Gifford, Robert J. (18 de noviembre de 2010). "Elementos virales endógenos en genomas animales". PLOS Genetics . 6 (11): e1001191. doi : 10.1371/journal.pgen.1001191 . PMC 2987831 . PMID 21124940.
- ^ Weiss, RA (3 de octubre de 2006). "El descubrimiento de retrovirus endógenos". Retrovirology . 3 : 67. doi : 10.1186/1742-4690-3-67 . PMC 1617120 . PMID 17018135.
- ^ Pakorn Aiewsakun, Aris Katzourakis (2015). "Virus endógenos: conectando la evolución viral reciente y antigua". J. Virol . 479–480: 26–37. doi : 10.1016/j.virol.2015.02.011 . PMID 25771486.
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- ^ Taylor, DJ; J. Bruenn (2009). "La evolución de nuevos genes fúngicos a partir de virus ARN no retrovirales". BMC Biology . 7 : 88. doi : 10.1186/1741-7007-7-88 . PMC 2805616 . PMID 20021636.
- ^ Koonin, E. (2010). "Domar a los astutos: nuevos genes eucariotas a partir de virus ARN". BMC Biology . 8 : 2. doi : 10.1186/1741-7007-8-2 . PMC 2823675 . PMID 20067611.
- ^ Lida, Atsuo (2020). "Endogenización hereditaria de un virus ARN en una especie de mamífero" (PDF) . bioRxiv . doi : 10.1101/2020.01.19.911933 .
- ^ "Un virus fósil antiguo muestra que la infección tiene millones de años", por Katherine Harmon, Scientific American , 29 de septiembre de 2010
- ^ "Cómo resucitar un retrovirus extinto", Scientific American , 2 de noviembre de 2006
- ^ Yong, Ed (3 de marzo de 2014). "Virus gigante resucitado a partir de hielo de 69.000 años de antigüedad". Nature . doi :10.1038/nature.2014.14801. S2CID 87146458.
- ^ Morelle, Rebecca (3 de marzo de 2014). "Un virus gigante de 30.000 años 'vuelve a la vida'". BBC News .