El Naumburg SC fue un club de fútbol alemán que jugaba en Naumburg , Sajonia-Anhalt. El club se fundó el 29 de septiembre de 1899 y fue el primero que se formó en la ciudad. El Naumburg , que formaba parte de la Verband Mitteldeutscher Ballspiel-Vereine (VMBV), jugaba sus partidos como local en el Vogelwiese ("prado de los pájaros") vistiendo los colores del equipo, blanco y negro.
El Naumburg SC solo es conocido por ser miembro fundador de la Asociación Alemana de Fútbol (Deutscher Fussball Bund o Asociación Alemana de Fútbol) en Leipzig en 1900, ya que desapareció de la escena del fútbol alemán pronto cuando el club se disolvió en 1908.
En 2016, los clubes tradicionales locales Naumburger SV 1905 y Naumburger BC 1920 decidieron fusionarse a partir del 1 de julio de 2017 y utilizar el nombre SC Naumburg para el nuevo club resultante.