Durante la Guerra Civil estadounidense, en el Ejército de los Estados Confederados había tres formaciones conocidas como el Ejército de Misisipi . Este nombre contrasta con el de Ejército de Misisipi , que era un ejército de la Unión que llevaba el nombre del río Misisipi , no del estado de Misisipi .
Este ejército, a veces conocido con el nombre de Ejército del Oeste , fue uno de los más importantes en el teatro de operaciones del Oeste , combatiendo en Shiloh, Corinth y Perryville . Se organizó el 5 de marzo de 1862 y se le añadieron partes del Ejército de Pensacola el 13 de marzo. Se consolidó con el Ejército de Kentucky Central y el Ejército de Luisiana el 29 de marzo. El 20 de noviembre de 1862, pasó a llamarse Ejército de Tennessee .
El segundo ejército se denominó Ejército de Vicksburg . Fue organizado el 7 de diciembre de 1862 por tropas del Departamento de Misisipi y el Este de Luisiana, incluido el efímero Ejército de Tennessee Occidental . Su única función era defender Vicksburg, Misisipi , en el río Misisipi . Dejó de existir cuando el general sureño John C. Pemberton lo entregó después de una larga campaña ofensiva y un asedio al mayor general Ulysses S. Grant el 4 de julio de 1863, abriendo el "Padre de las Aguas" al control de la Unión y dividiendo la Confederación en dos.
El tercer ejército pasó a llamarse III Cuerpo, Ejército de Tennessee , alrededor del 4 de mayo de 1864, pero continuó usando el nombre anterior.