Egidio Boccanegra era hermano de Simone Boccanegra , el primer dux de Génova . En 1340 Egidio dirigió una fuerza de tropas genovesas al servicio de Felipe VI de Francia en la batalla naval de Sluys . A pesar de la derrota casi total de la flota francesa en esta batalla, Egidio pudo retirar su flotilla casi ileso y luego entró al servicio de Alfonso XI de Castilla en una guerra contra las tropas marroquíes. Al año siguiente, Pedro IV de Aragón nombró a Egidio su almirante.
Boccanegra fue ejecutado en Sevilla en 1367 por su apoyo a Enrique II de Castilla .