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EMBOSS es un paquete de análisis de software libre desarrollado para las necesidades de la comunidad de usuarios de biología molecular y bioinformática . [1] El software maneja automáticamente datos en una variedad de formatos e incluso permite la recuperación transparente de datos de secuencias de la web. Además, como el paquete incluye bibliotecas extensas, es una plataforma que permite a otros científicos desarrollar y publicar software con un verdadero espíritu de código abierto. EMBOSS también integra una gama de paquetes y herramientas disponibles actualmente para el análisis de secuencias en un todo sin fisuras.

EMBOSS es el acrónimo de European Molecular Biology Open Software Suite . La parte europea del nombre indica un alcance más amplio. Los grupos centrales de EMBOSS están colaborando con muchos otros grupos para desarrollar las nuevas aplicaciones que necesitan los usuarios. Esto se hizo desde el principio con EMBnet , la Red Europea de Biología Molecular. EMBnet tiene muchos nodos en todo el mundo, la mayoría de los cuales son servicios nacionales de bioinformática. EMBnet tiene la experiencia en programación. En septiembre de 1998, se celebró el primer taller, cuando 30 personas de EMBnet fueron a Hinxton para aprender sobre EMBOSS y discutir el camino a seguir. [2]

El paquete EMBOSS contiene una variedad de aplicaciones para alineación de secuencias , búsqueda rápida en bases de datos con patrones de secuencia, identificación de motivos de proteínas (incluido análisis de dominios) y mucho más.

Las bibliotecas AJAX y NUCLEUS se publican bajo la Licencia Pública General de Bibliotecas GNU . Las aplicaciones EMBOSS se publican bajo la Licencia Pública General de Bibliotecas GNU . [3]

Grupos de aplicaciones EMBOSS

Véase también

Referencias

  1. ^ Rice P, Longden I, Bleasby A (2000). "EMBOSS: La suite de software abierto europea para biología molecular". Tendencias en genética . 16 (6): 276–277. doi :10.1016/S0168-9525(00)02024-2. PMID  10827456.
  2. ^ Rice P, Bleasby A (1999). "EMBOSS: La suite de software abierto europea para biología molecular". Biochemist E-volution . 16 (6): 276–7. doi :10.1016/s0168-9525(00)02024-2. PMID  10827456.
  3. ^ "1.1. Información sobre la licencia".

Enlaces externos