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EFHC2

El dominio de mano EF (C-terminal) que contiene 2 es una proteína que en los humanos está codificada por el gen EFHC2 . [5] [6]

Gene

EFHC2 está ubicado en la cadena negativa ( cadena sentido ) del cromosoma X en p11.3. "EFHC2 es uno de los pocos genes seleccionados con evidencia in vitro que sugiere que escapa a la inactivación de X ". [7] EFHC2 abarca 195.796 pares de bases y está vecino de NDP , el gen que codifica la proteína de la enfermedad de Norrie . La evidencia preliminar basada en estudios de asociación de todo el genoma ha relacionado un SNP en el intrón entre los exones 13 y 14 de EFHC2 con la evitación de daños . [8]

La transcripción de ARNm que codifica la proteína EFHC2 tiene 3269 pares de bases. Los primeros noventa pares de bases componen la región de cinco principales no traducidas y los últimos 1913 pares de bases componen la región de tres principales no traducidas .

Proteína

El esquema muestra características clave de la proteína codificada por el gen EFHC2 en humanos. "DUF" se refiere a "dominio de función desconocida".

El gen EFHC2 codifica una proteína de 749 aminoácidos que contiene tres dominios DM10 ( InterProIPR006602 ) y tres motivos de mano EF de unión a calcio . [5]

Se estima que el punto isoeléctrico de EFHC2 es 7,13 en humanos. [9] En comparación con otras proteínas expresadas en humanos, EFHC2 tiene menos residuos de alanina y una mayor cantidad de residuos de tirosina y se predice que reside en el citoplasma. [10] [11]

Distribución de tejidos

EFHC2 se expresa ampliamente en el sistema nervioso central y en los tejidos periféricos. [12]

Significación clínica

Una proteína relacionada, EFHC1 , está codificada por un gen en el cromosoma 6. Se ha sugerido que ambas proteínas están involucradas en el desarrollo de la epilepsia [6] [13] y que este gen puede estar asociado con el reconocimiento del miedo en personas con síndrome de Turner . [5]

Una mutación en EFHC2 que da como resultado una sustitución de serina por tirosina en la posición del aminoácido 430 (S430Y) se ha asociado con la epilepsia mioclónica juvenil en una población masculina alemana. [6] Además, un polimorfismo de un solo nucleótido en EFHC2 se correlaciona con una capacidad reducida de los pacientes con síndrome de Turner para reconocer el miedo en las expresiones faciales; [14] sin embargo, estos hallazgos siguen siendo controvertidos. [15]

Conservación en otras especies

Referencias

  1. ^ abc GRCh38: Ensembl lanzamiento 89: ENSG00000183690 - Ensembl , mayo de 2017
  2. ^ abc GRCm38: Ensembl lanzamiento 89: ENSMUSG00000025038 - Ensembl , mayo de 2017
  3. ^ "Referencia humana de PubMed:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  4. ^ "Referencia de PubMed del ratón:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  5. ^ abc "Entrez Gene: dominio de mano EF (terminal C) que contiene 2" . Consultado el 7 de mayo de 2012 .
  6. ^ abc Gu W, Sander T, Heils A, Lenzen KP, Steinlein OK (2005). "Una nueva mano EF que contiene el gen EFHC2 en Xp11.4: evidencia provisional de asociación con la epilepsia mioclónica juvenil". Investigación sobre epilepsia . 66 (1–3): 91–8. doi :10.1016/j.eplepsyres.2005.07.003. PMID  16112844. S2CID  25572315.
  7. ^ Castagné R, Zeller T, Rotival M, Szymczak S, Truong V, Schillert A, Trégouët DA, Münzel T, Ziegler A, Cambien F, Blankenberg S, Tiret L (noviembre de 2011). "Influencia del sexo y la variabilidad genética en la expresión de genes ligados al cromosoma X en monocitos humanos". Genómica . 98 (5): 320–6. doi : 10.1016/j.ygeno.2011.06.009 . PMID  21763416.
  8. ^ Blaya C, Moorjani P, Salum GA, Gonçalves L, Weiss LA, Leistner-Segal S, Manfro GG, Smoller JW (marzo de 2009). "Evidencia preliminar de asociación entre EFHC2, un gen implicado en el reconocimiento del miedo y la evitación de daños". Cartas de Neurociencia . 452 (1): 84–6. doi :10.1016/j.neulet.2009.01.036. PMID  19429002. S2CID  39604977.
  9. ^ Wilkins MR, Gasteiger E, Bairoch A, Sánchez JC, Williams KL, Appel RD, Hochstrasser DF (1999). "Herramientas de identificación y análisis de proteínas en el servidor ExPASy". Protocolos de análisis de proteomas 2-D . Métodos en biología molecular. vol. 112, págs. 531–52. doi :10.1385/1-59259-584-7:531. ISBN 1-59259-584-7. PMID  10027275.
  10. ^ Brendel V, Bucher P, Nourbakhsh IR, Blaisdell BE, Karlin S (marzo de 1992). "Métodos y algoritmos para el análisis estadístico de secuencias de proteínas". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 89 (6): 2002–6. Código bibliográfico : 1992PNAS...89.2002B. doi : 10.1073/pnas.89.6.2002 . PMC 48584 . PMID  1549558. 
  11. ^ Horton P, Nakai K (1997). "Mejor predicción de los sitios de localización celular de proteínas con el clasificador de k vecinos más cercanos". Actas. Congreso Internacional sobre Sistemas Inteligentes para Biología Molecular . 5 : 147–52. PMID  9322029.
  12. ^ Weiss LA, Purcell S, Waggoner S, Lawrence K, Spektor D, Daly MJ, Sklar P, Skuse D (enero de 2007). "Identificación de EFHC2 como un locus de rasgo cuantitativo para el reconocimiento del miedo en el síndrome de Turner". Genética Molecular Humana . 16 (1): 107–13. doi : 10.1093/hmg/ddl445 . PMID  17164267.
  13. ^ Suzuki T, Delgado-Escueta AV, Aguan K, Alonso ME, Shi J, Hara Y, Nishida M, Numata T, Medina MT, Takeuchi T, Morita R, Bai D, Ganesh S, Sugimoto Y, Inazawa J, Bailey JN , Ochoa A, Jara-Prado A, Rasmussen A, Ramos-Peek J, Cordova S, Rubio-Donnadieu F, Inoue Y, Osawa M, Kaneko S, Oguni H, Mori Y, Yamakawa K (agosto de 2004). "Las mutaciones en EFHC1 provocan epilepsia mioclónica juvenil". Genética de la Naturaleza . 36 (8): 842–9. doi :10.1038/ng1393. PMID  15258581. S2CID  32916803.
  14. ^ Rodríguez-Revenga L, Madrigal I, Alkhalidi LS, Armengol L, González E, Badenas C, Estivill X, Milà M (mayo de 2007). "Deleción contigua de los genes NDP, MAOA, MAOB y EFHC2 en un paciente con enfermedad de Norrie, retraso psicomotor severo y epilepsia mioclónica". Revista Estadounidense de Genética Médica , Parte A. 143A (9): 916–20. doi :10.1002/ajmg.a.31521. PMID  17431911. S2CID  36917690.
  15. ^ Zinn AR, Kushner H, Ross JL (junio de 2008). "EFHC2 SNP rs7055196 no está asociado con el reconocimiento del miedo en el síndrome de Turner 45,X". Revista Estadounidense de Genética Médica , Parte B. 147B (4): 507–9. doi :10.1002/ajmg.b.30625. PMID  17948898. S2CID  36643937.