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ARN pequeños codificados por el virus de Epstein-Barr

Los ARN pequeños codificados por el virus de Epstein-Barr (EBER) son ARN pequeños no codificantes localizados en el núcleo de las células humanas infectadas con el virus de Epstein-Barr (VEB). Descubiertos por primera vez en 1981, los EBER son los ARN más abundantes presentes en las células infectadas. [1] Los EBER interactúan con varias proteínas del huésped para formar complejos de ribonucleoproteína (RNP). Aunque sigue sin conocerse una función precisa para los EBER, se han propuesto papeles en la transformación y la oncogénesis . También se ha demostrado que están presentes en los exosomas liberados de las células infectadas y podrían estar involucrados en la interacción entre células. [2] [3]

Fondo

EBER1 y EBER2 son ARN no codificantes enriquecidos con núcleo , cortos, de 167 y 172 nucleótidos de longitud respectivamente . Estos dos ARN son transcritos por la ARN polimerasa III del huésped durante la infección latente de EBV. [4] [5]

Los EBER 1 y 2 pueden eliminarse del genoma viral sin cambios fenotípicos notables , aunque nunca se ha encontrado esta eliminación en la naturaleza. [4] La expresión de EBER por sí sola puede inducir tumores en ratones inmunodeficientes combinados graves . [6] [7]

EBER1

EBER1 se asocia con la proteína ribosomal humana L22 [8] y hace que esta proteína se mueva desde el nucléolo hasta el nucleoplasma . [9] EBER1 también interactúa específicamente con al menos tres hnRNP del huésped (A1, A2/B1 y D/ AUF1 ). [10]

EBER2

Estructura secundaria de consenso para EBER2

De manera similar a EBER1, EBER2 se expresa en gran medida en células latentemente infectadas. A diferencia de EBER1, la secuencia de EBER2 está menos conservada en herpesvirus relacionados (~50% de conservación). Sin embargo, la estructura secundaria de EBER2 está altamente conservada (ver Figura 1). Se sabe que EBER2 solo se une a proteínas celulares (específicamente, el dominio La ) en su tramo terminal de uridinas repetidas; sin embargo, se cree que las otras características de EBER2, particularmente sus dos bucles de tallo largos y altamente conservados , también pueden servir como sitios de unión para proteínas aún desconocidas. [11]

Richard Ambinder fue pionero en la aplicación de la hibridación in situ EBER para la detección del virus de Epstein-Barr en muestras clínicas en 1990. [12] La abundancia de dianas EBER en células con infección latente por VEB y la facilidad de la metodología no isotópica en secciones de tejido fijadas con formalina e incluidas en cera de parafina hicieron que la hibridación in situ EBER fuera eminentemente adecuada para la práctica clínica. [13] [14] [15] La detección de EBER se ha convertido en un componente integral de la histopatología diagnóstica de rutina. [16] [17]

Referencias

  1. ^ Lerner MR, Andrews NC, Miller G, Steitz JA (febrero de 1981). "Dos ARN pequeños codificados por el virus de Epstein-Barr y complejos con proteínas son precipitados por anticuerpos de pacientes con lupus eritematoso sistémico". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 78 (2): 805–809. doi : 10.1073/pnas.78.2.805 . PMC  319891 . PMID  6262773.
  2. ^ Ahmed, Waqar; Tariq, Saeed; Khan, Gulfaraz (18 de octubre de 2018). "Seguimiento de los ARN codificados por el virus de Epstein-Barr (EBER) desde el núcleo hasta los exosomas excretados de los linfocitos B". Scientific Reports . 8 (1): 15438. doi :10.1038/s41598-018-33758-4. ISSN  2045-2322. PMC 6193935 . PMID  30337610. 
  3. ^ Ahmed, Waqar; Philip, Pretty S.; Attoub, Samir; Khan, Gulfaraz (diciembre de 2015). "Las células infectadas por el virus de Epstein-Barr liberan el ligando Fas en fracciones exosomales e inducen la apoptosis en las células receptoras a través de la vía extrínseca". The Journal of General Virology . 96 (12): 3646–3659. doi :10.1099/jgv.0.000313. ISSN  1465-2099. PMID  26467838.
  4. ^ ab Conrad NK, Fok V, Cazalla D, Borah S, Steitz JA (2006). "El desafío de los snRNP virales". Simposios de Cold Spring Harbor sobre biología cuantitativa . 71 : 377–384. doi : 10.1101/sqb.2006.71.057 . PMID  17381320.
  5. ^ Moss WN, Lee N, Pimienta G, Steitz JA (2014). "Familias de ARN en el virus de Epstein-Barr". RNA Biology . 11 (1): 10–17. doi :10.4161/rna.27488. PMC 3929418 . PMID  24441309. 
  6. ^ Komano J, Maruo S, Kurozumi K, Oda T, Takada K (diciembre de 1999). "Papel oncogénico de los ARN codificados por el virus de Epstein-Barr en la línea celular de linfoma de Burkitt Akata". Revista de Virología . 73 (12): 9827–9831. doi :10.1128/JVI.73.12.9827-9831.1999. PMC 113031 . PMID  10559294. 
  7. ^ Yamamoto N, Takizawa T, Iwanaga Y, Shimizu N, Yamamoto N (noviembre de 2000). "Transformación maligna de la línea celular de linfoma B BJAB por ARN pequeños codificados por el virus de Epstein-Barr". Cartas FEBS . 484 (2): 153-158. doi :10.1016/S0014-5793(00)02145-1. PMID  11068051. S2CID  35288002.
  8. ^ Fok V, Mitton-Fry RM, Grech A, Steitz JA (mayo de 2006). "Múltiples dominios de EBER 1, un ARN no codificante del virus de Epstein-Barr, reclutan la proteína ribosomal humana L22". ARN . 12 (5): 872–882. ​​doi :10.1261/rna.2339606. PMC 1440895 . PMID  16556938. 
  9. ^ Toczyski DP, Matera AG, Ward DC, Steitz JA (abril de 1994). "El ARN pequeño EBER1 del virus de Epstein-Barr (VEB) se une y relocaliza la proteína ribosomal L22 en linfocitos B humanos infectados con VEB". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 91 (8): 3463–3467. doi : 10.1073/pnas.91.8.3463 . PMC 43597 . PMID  8159770. 
  10. ^ Lee N, Pimienta G, Steitz JA (noviembre de 2012). "AUF1/hnRNP D es una nueva proteína asociada al ARN no codificante EBER1 del virus de Epstein-Barr". ARN . 18 (11): 2073–2082. doi :10.1261/rna.034900.112. PMC 3479396 . PMID  23012480. 
  11. ^ Moss WN, Lee N, Pimienta G, Steitz JA (20 de diciembre de 2013). "Familias de ARN en el virus de Epstein-Barr". RNA Biology . 11 (1): 10–17. doi :10.4161/rna.27488. PMC 3929418 . PMID  24441309. 
  12. ^ Wu, Tzyy-Choou; Mann, Risa B.; Charache, Patricia; Hayward, S. Diane; Staal, Steve; Lambe, Beverly C.; Ambinder, Richard F. (15 de noviembre de 1990). "Detección de la expresión del gen ebv en células de Reed-Sternberg de la enfermedad de Hodgkin". Revista Internacional del Cáncer . 46 (5): 801–804. doi :10.1002/ijc.2910460509. PMID  2172169. S2CID  22788289.
  13. ^ Barletta, Janet M.; Kingma, Douglas W.; Ling, Yun; Charache, Patricia; Mann, Risa B.; Ambinder, Richard F. (abril de 1993). "Hibridación rápida in situ para el diagnóstico de la infección latente por el virus de Epstein-Barr". Sondas moleculares y celulares . 7 (2): 105–109. doi : 10.1006/mcpr.1993.1014 . PMID  8391639.
  14. ^ Khan, G.; Coates, PJ; Kangro, HO; Slavin, G. (julio de 1992). "El virus de Epstein Barr (VEB) codifica pequeñas ARN: objetivos para la detección mediante hibridación in situ con sondas de oligonucleótidos". Journal of Clinical Pathology . 45 (7): 616–620. doi :10.1136/jcp.45.7.616. ISSN  0021-9746. PMC 495191 . PMID  1325480. 
  15. ^ Khan, G.; Coates, PJ; Gupta, RK; Kangro, HO; Slavin, G. (abril de 1992). "La presencia del virus de Epstein-Barr en la enfermedad de Hodgkin no es exclusiva de las células de Reed-Sternberg". The American Journal of Pathology . 140 (4): 757–762. ISSN  0002-9440. PMC 1886366 . PMID  1314022. 
  16. ^ Khan, Gulfaraz (2009). "Detección del virus de Epstein-Barr en el linfoma de Hodgkin". Métodos en biología molecular . 511 : 311–322. doi :10.1007/978-1-59745-447-6_13. ISSN  1064-3745. PMID  19347303.
  17. ^ Weiss, Lawrence M; Chen, Yuan-Yuan (1 de enero de 2013). "Hibridación in situ EBER para el virus de Epstein-Barr". Métodos en biología molecular . 999 : 223–30. doi :10.1007/978-1-62703-357-2_16. PMID  23666702.

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