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Festucas de Epichloe

Epichloë festucae es un hongo endófito sistémico y transmisible por semillasde las gramíneas de estación fría. [1]

Descrita por primera vez en 1994, [2] Epichloë festucae es un linaje hermano de Epichloë amarillans , Epichloë baconii , Epichloë mollis y Epichloë stromatolonga . Epichloë festucae se encuentra en toda América del Norte, donde vive en las especies de gramíneas Bromus kalmii y Elymus spp. (incluyendo Elymus patula ).

Genoma

La secuencia completa del genoma de Epichloë festucae , la primera secuencia completa del genoma de cualquier especie del género Epichloë , se informó en 2018. El genoma de 35 Mb comprende 7 cromosomas, que van desde 3,2 a 7,8 Mb, incluidos aproximadamente 9000 genes. [3]

Centrómeros

A partir de 2020 , si bien se dispone de algunos datos de secuencias de centrómeros , no se dispone de una anotación completa de todos los marcos de lectura abiertos . Como resultado, aún no es posible realizar un análisis taxonómico completo. [4]

Variedades

Las cepas de Epichloë festucae pueden tener tanto una forma reproductiva sexual ( teleomorfo ) como una forma reproductiva asexual ( anamorfo ). Para este grupo, las formas anamorfas se clasificaron por separado durante mucho tiempo: inicialmente en el género Acremonium , [5] y después de 1996, en el nuevo género Neotyphodium . [6] Desde 2011, el código de nomenclatura exige que se utilice un único nombre para todas las etapas de desarrollo de una especie de hongo y, tras una revisión taxonómica del género Epichloë en 2014, las formas asexuales de Epichloë festucae ahora se clasifican como Epichloë festucae var. lolii . [1]

Encontrada en Europa, Asia y el norte de África, e introducida en Nueva Zelanda , Australia y otros lugares, Epichloë festucae var. lolii está asociada con la especie de gramínea Lolium perenne subsp. perenne .

Referencias

  1. ^ ab Leuchtmann, A.; Bacon, C. W.; Schardl, CL; White, JF; Tadych, M. (2014). "Realineamiento nomenclatural de especies de Neotyphodium con género Epichloë ". Mycologia . 106 (2): 202–215. doi :10.3852/13-251. PMID  24459125. S2CID  25222557.
  2. ^ Leuchtmann, Adrian; Schardl, Christopher L.; Siegel, Malcolm R. (1994). "Compatibilidad sexual y taxonomía de una nueva especie de Epichloë simbiótica con pastos de festuca fina". Mycologia . 86 (6): 802–812. doi :10.1080/00275514.1994.12026487. ISSN  0027-5514.
  3. ^ Winter, David J.; Ganley, Austen RD; Young, Carolyn A.; Liachko, Ivan; Schardl, Christopher L.; Dupont, Pierre-Yves; Berry, Daniel; Ram, Arvina; Scott, Barry; Cox, Murray P. (2018). "Los elementos repetidos organizan la estructura 3D del genoma y median la transcripción en el hongo filamentoso Epichloë festucae". PLOS Genetics . 14 (10): e1007467. doi : 10.1371/journal.pgen.1007467 . ISSN  1553-7404. PMC 6218096 . PMID  30356280. 
  4. ^ Guin, Krishnendu; Sreekumar, Lakshmi; Sanyal, Kaustuv (8 de septiembre de 2020). "Implicaciones de la trayectoria evolutiva de los centrómeros en el reino fúngico". Revisión anual de microbiología . 74 (1). Revisiones anuales : 835–853. doi : 10.1146/annurev-micro-011720-122512 . ISSN  0066-4227. PMID  32706633. S2CID  225320859.
  5. ^ Morgan-Jones, G.; Gams, W. (1982). "Notas sobre hifomicetos. XLI. Un endófito de Festuca arundinacea y el anamorfo de Epichloe typhina , nuevos taxones en una de las dos nuevas secciones de Acremonium ". Mycotaxon . 15 : 311–318.
  6. ^ Glenn AE, Bacon CW, Price R, Hanlin RT (1996). "Filogenia molecular de Acremonium y sus implicaciones taxonómicas". Mycologia . 88 (3). Sociedad Micológica de América: 369–383. doi :10.2307/3760878. JSTOR  3760878.