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Desulfitobacteria hafniense

Desulfitobacterium hafniense es una especie de bacteria gram positiva ,su cepa tipo es DCB-2 T. [1] (ID de taxonomía NCBI 272564; DSM 10664).

D. hafniense son bacterias anaeróbicas formadoras de esporas . La mayoría de los aislados descritos son bacterias que respiran organohalogenuros de manera facultativa y son capaces de declorar de manera reductiva organohalogenuros como los clorofenoles y el tetracloroeteno . Las células de D. hafniense tienen forma de bastón y miden de 3,3 a 6 μm de largo por 0,6 a 0,7 μm de ancho, son móviles y cada célula tiene uno o dos flagelos terminales . Todas las cepas analizadas son resistentes al antibiótico vancomicina . [2] [3]

A lo largo de los años se han descrito varias cepas adicionales pertenecientes a la especie hafniense en una amplia gama de entornos. Las cepas PCP-1, TCE1, DP7, TCP-A y G2 se publicaron originalmente como miembros de una especie separada , Frappieri, pero hoy en día se considera que todas pertenecen a la especie hafniense . [4] [5]

Genomas

El genoma de D. hafniense contiene la maquinaria para la pirrolisina y la selenocisteína , lo que lo convierte en el único organismo conocido que potencialmente utiliza 22 aminoácidos en la traducción de proteínas. [14] La cepa DCB-2 T de Desulfitobacterium hafniense tiene un solo genoma circular que contiene 5,78 Mbp que codifican 5045 genes. El genoma de la cepa DCB-2 T de Desulfitobacterium hafniense alberga siete genes que codifican deshalogenasas reductoras, cinco de estos parecen ser funcionales y dos están alterados por mutaciones. [15]

Se dispone de información completa sobre la secuencia genómica de nueve cepas de Desulfitobacterium hafniense . Todas ellas tienen tamaños de genoma que van desde 5 a 5,7 Mbp; ninguna de las cepas secuenciadas contiene plásmidos. Los genomas codifican solo un número limitado de deshalogenasas reductoras , además de genes para utilizar una amplia gama de donantes y aceptores de electrones.


Referencias

  1. ^ ab Christiansen N, Ahring BK (1996). "Desulfitobacterium hafniense sp. nov., una bacteria anaeróbica que declora de forma reductiva". Revista internacional de bacteriología sistemática . 46 (2): 442–448. doi : 10.1099/00207713-46-2-442 .
  2. ^ Kalan L, Ebert S, Kelly T, Wright GD (julio de 2009). "Clúster de resistencia a la vancomicina no canónico de Desulfitobacterium hafniense Y51". Agentes antimicrobianos y quimioterapia . 53 (7): 2841–5. doi :10.1128/AAC.01408-08. PMC 2704641. PMID  19414574 . 
  3. ^ Kruse T, Levisson M, de Vos WM, Smidt H (septiembre de 2014). "vanI: un nuevo grupo de genes de resistencia a la vancomicina D-Ala-D-Lac encontrado en Desulfitobacterium hafniense". Biotecnología microbiana . 7 (5): 456–66. doi :10.1111/1751-7915.12139. PMC 4229326 . PMID  25042042. 
  4. ^ ab Niggemyer A, Spring S, Stackebrandt E, Rosenzweig RF (diciembre de 2001). "Aislamiento y caracterización de una nueva bacteria reductora de As(V): implicaciones para la movilización de arsénico y el género Desulfitobacterium". Microbiología aplicada y ambiental . 67 (12): 5568–80. doi :10.1128/AEM.67.12.5568-5580.2001. PMC 93345 . PMID  11722908. 
  5. ^ Villemur R, Lanthier M, Beaudet R, Lépine F (septiembre de 2006). "El género Desulfitobacterium". Reseñas de microbiología FEMS . 30 (5): 706–33. doi : 10.1111/j.1574-6976.2006.00029.x . PMID  16911041.
  6. ^ Bouchard B, Beaudet R, Villemur R, McSween G, Lépine F, Bisaillon JG (octubre de 1996). "Aislamiento y caracterización de Desulfitobacterium frappieri sp. nov., una bacteria anaeróbica que declora de forma reductiva el pentaclorofenol a 3-clorofenol". Revista internacional de bacteriología sistemática . 46 (4): 1010–5. doi : 10.1099/00207713-46-4-1010 . PMID  8863430.
  7. ^ Breitenstein A, Saano A, Salkinoja-Salonen M, Andreesen JR, Lechner U (febrero de 2001). "Análisis de un cultivo de enriquecimiento deshalogenante de 2,4,6-triclorofenol y aislamiento del miembro deshalogenante Desulfitobacterium frappieri cepa TCP-A". Archivos de Microbiología . 175 (2): 133–42. doi :10.1007/s002030000248. PMID  11285741. S2CID  25261490.
  8. ^ Suyama A, Iwakiri R, Kai K, Tokunaga T, Sera N, Furukawa K (julio de 2001). "Aislamiento y caracterización de la cepa Y51 de Desulfitobacterium sp. capaz de deshalogenar de manera eficiente tetracloroeteno y policloroetanos". Biociencia, biotecnología y bioquímica . 65 (7): 1474–81. doi : 10.1271/bbb.65.1474 . PMID  11515528. S2CID  11762181.
  9. ^ Gerritse J, Drzyzga O, Kloetstra G, Keijmel M, Wiersum LP, Hutson R, Collins MD, Gottschal JC (diciembre de 1999). "Influencia de diferentes donantes y aceptores de electrones en la deshalorespiración de tetracloroeteno por Desulfitobacterium frappieri TCE1". Microbiología Aplicada y Ambiental . 65 (12): 5212–21. doi :10.1128/AEM.65.12.5212-5221.1999. PMC 91707 . PMID  10583967. 
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  19. ^ abcde Kruse T, Goris T, Maillard J, Woyke T, Lechner U, de Vos W, Smidt H (diciembre de 2017). "Genómica comparativa del género Desulfitobacterium". FEMS Microbiology Ecology . 93 (12). doi : 10.1093/femsec/fix135 . PMID  29040502.

Lectura adicional

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