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Base de datos de diversidad conformacional de proteínas.

La base de datos de diversidad conformacional de proteínas ( PCDB ) es una base de datos de diversidad de estructuras terciarias de proteínas dentro de dominios proteicos según lo determinado por cristalografía de rayos X. [1] [2] Las proteínas son inherentemente flexibles y esta base de datos recopila información sobre este tema para su uso en la investigación molecular. Utiliza la base de datos CATH como fuente de estructuras para cada proteína e informa el rango de diferencias en las estructuras en función de su superposición e informa un RMSD máximo . La interfaz de la base de datos permite a los investigadores encontrar proteínas con una gama de flexibilidad conformacional que les permite encontrar proteínas altamente flexibles, por ejemplo. La base de datos es administrada y mantenida por un grupo de investigadores de la Universidad Nacional de Quilmes en Argentina. [ cita necesaria ]

Ver también

Referencias

  1. ^ ab Juritz EI, Alberti SF, Parisi GD (enero de 2011). "PCDB: una base de datos de diversidad conformacional de proteínas". Ácidos nucleicos Res . 39 (Problema de la base de datos): D475–9. doi : 10.1093/nar/gkq1181. PMC  3013735 . PMID  21097895.
  2. ^ Galperin MY, Cochrane GR (enero de 2011). "La edición de la base de datos de investigación de ácidos nucleicos de 2011 y la colección de bases de datos de biología molecular en línea". Ácidos nucleicos Res . 39 (Problema de la base de datos): D1–6. doi : 10.1093/nar/gkq1243. PMC 3013748 . PMID  21177655. 

enlaces externos