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DIALIGN-TX

DIALIGN-TX es un programa de alineamiento de secuencias múltiples escrito por Amarendran R. Subramanian y es una mejora sustancial de DIALIGN-T al combinar estrategias de alineamiento progresivo y codicioso en un nuevo algoritmo.

El DIALIGN-T original es una reimplementación del programa de alineamiento múltiple DIALIGN. Debido a varias mejoras algorítmicas, produce alineamientos significativamente mejores en conjuntos de secuencias relacionadas local y globalmente que las versiones anteriores de DIALIGN. Sin embargo, al igual que la implementación original del programa, DIALIGN-T utiliza un enfoque voraz sencillo para ensamblar alineamientos múltiples a partir de similitudes de secuencias locales por pares. Estos enfoques voraces pueden ser vulnerables a similitudes aleatorias espurias y, por lo tanto, pueden conducir a resultados subóptimos. DIALIGN-TX es una mejora sustancial de DIALIGN-T que combina el algoritmo voraz anterior con un enfoque de alineamiento progresivo.

Véase también

Referencias

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