La Copa de Eslovaquia 2000-01 fue la 32.ª temporada de la competición anual de copa eliminatoria de Eslovaquia [1] y la octava desde la independencia de Eslovaquia . Comenzó el 25 de julio de 2000 con los partidos de la ronda preliminar y finalizó el 8 de mayo de 2001 con la final. Los ganadores de la competición obtuvieron un lugar en la ronda de clasificación de la Copa de la UEFA. El Inter de Bratislava fue el campeón defensor.
Los partidos de ida se jugaron el 25 y 26 de julio de 2000. Los partidos de vuelta se jugaron el 2 de agosto de 2000.
Los partidos se jugaron el 19 y 20 de septiembre de 2000.
Los siete partidos se jugaron el 7 y 8 de noviembre de 2000 y el partido NCHZ Nováky – Inter Bratislava se jugó el 21 de noviembre de 2000.
Los tres partidos se jugaron el 21 y 22 de noviembre de 2000 y el partido Koba Senec – Inter Bratislava se jugó el 29 de noviembre de 2000.
Los partidos de ida se jugaron el 13 de marzo de 2001. Los partidos de vuelta se jugaron el 3 de abril de 2001.