La Copa México 1989-90 fue la 62.ª edición de la Copa México , la 35.ª edición en la era profesional.
La competencia inició el 17 de enero de 1990 y concluyó el 18 de abril de 1990 con la final, celebrada en el Estadio Cuauhtémoc de la ciudad de Puebla , en la que Puebla levantó el trofeo por cuarta ocasión en su historia al vencer 4-3 a Tigres UANL .
Para esta edición, los equipos fueron clasificados del 1 al 20 según los puntos al final de la ronda 19 en la liga 1989-90:
Puebla FC avanza a la final con global de 2-1
El Puebla FC avanza a la final con un global de 2-1 en goles de visitante
Puebla ganó la Copa con marcador global de 4-3