La Copa Indonesia 2008-09 fue la cuarta edición de Piala Indonesia , el torneo de fútbol de nivel nacional en Indonesia , en el que participaron clubes de la Superliga de Indonesia , la Premier Division y la Primera División . El Sriwijaya FC fue el campeón defensor del torneo. El ganador del torneo se clasificó para jugar la clasificación para la Liga de Campeones de la AFC 2010 .
Sriwijaya se proclamó campeón por segundo año consecutivo después de una victoria por 4-0 sobre Persipura Jayapura en el partido final en el estadio Jakabaring de Palembang . [1]
Sriwijaya , Persipura Jayapura , Persija Jakarta y Pelita Jaya pasaron a la tercera ronda.