La European Challenge Cup 2008-09 fue la decimotercera temporada de la European Challenge Cup , la competición anual de clubes de rugby de Europa para clubes de seis naciones en el rugby europeo. Comenzó en octubre de 2008 y terminó con la final en Twickenham Stoop en Londres el 22 de mayo de 2009, en la que Northampton Saints derrotó a Bourgoin por 15-3. Con la victoria, los Saints no solo se llevaron el trofeo, sino que también ganaron un lugar en la Heineken Cup 2009-10 .
Siete equipos franceses compitieron en lugar de los ocho habituales, ya que un equipo francés, Toulouse , avanzó más lejos en la Copa Heineken del año anterior que cualquier equipo inglés o italiano.
Las demás naciones tuvieron su número habitual de participantes: Inglaterra seis, Italia cuatro, Irlanda uno, España uno y Rumania uno. [1]
El sorteo de la fase de grupos tuvo lugar el 23 de junio de 2008. El sorteo se llevó a cabo utilizando el sistema de clasificación europea ERC, que se basó en las actuaciones de los equipos clasificados y su participación en la Heineken Cup y las fases eliminatorias de la European Challenge Cup durante las últimas cuatro temporadas.
A diferencia de la Heineken Cup, la Challenge Cup no realizó un sorteo de semifinales en ese momento (tal sorteo se instituiría para la edición 2009-10 ). La mitad superior del sorteo emparejó a los sembrados 1 y 8 en un cuarto de final, y a los sembrados 4 y 5 en el otro, y la mitad inferior emparejó a 2 contra 7 y 3 contra 6; los sembrados más altos (de número más bajo) jugaron todos en casa. La etapa eliminatoria no se reorganizó después de los cuartos de final. La ventaja de local para las semifinales se otorgó al sembrado más alto restante en cada mitad del sorteo. La ventaja de local en la final fue para el sembrado más alto restante.