El Comisario Civil de Malta ( en maltés : Kummissarju Ċivili ta' Malta ) fue un funcionario que gobernó Malta durante el bloqueo francés y más tarde el período del protectorado británico entre 1799 y 1813. Tras el final del Protectorado y la creación de la Colonia de la Corona de Malta en 1813, este cargo fue reemplazado por el de gobernador , que representaba al Gobierno del Reino Unido .