La Universidad de Clermont-Ferrand fue fundada oficialmente en 1896, mediante la fusión de dos facultades existentes (Literatura y Ciencias) y una escuela de medicina.
En 1976, debido a problemas políticos, la Universidad se dividió entre la Universidad Clermont-Ferrand I - Universidad de Auvernia y la Universidad Clermont-Ferrand II - Universidad Blaise Pascal ; [1] estas últimas volvieron a fusionarse en la Universidad Clermont Auvernia en 2017.