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Ciclización in situ de proteínas

La ciclización in situ de proteínas ( INCYPRO ) es una tecnología de ingeniería de proteínas que aumenta la durabilidad de las proteínas y enzimas para aplicaciones biotecnológicas y biomédicas. [1] [2] Para tales aplicaciones, es esencial que las proteínas utilizadas mantengan su integridad estructural. [3] Sin embargo, esto a menudo es un desafío debido a las condiciones requeridas para estas aplicaciones que requieren ingeniería de proteínas para estabilizar la estructura de la proteína. [4] La tecnología INCYPRO implica la unión de ligaduras moleculares (enlaces cruzados) a una proteína, reduciendo así la tendencia de la proteína a desplegarse. Las proteínas reticuladas con INCYPRO resultantes son más estables a temperatura elevada y en presencia de desnaturalizantes químicos. [5]

Tecnología

La tecnología INCYPRO utiliza moléculas tris-reactivas para reticular tres posiciones definidas dentro de una proteína [1] o complejo proteico. [6] Por ejemplo, INCYPRO puede implicar la introducción de tres cisteínas alineadas espacialmente y accesibles al solvente en la proteína que luego se hacen reaccionar con un agente tris-electrófilo. Se ha demostrado que las proteínas o complejos proteicos reticulados resultantes exhiben una mayor estabilidad frente al estrés térmico y químico y una menor tendencia a la agregación. [1] [6] Hasta ahora, la temperatura de fusión de las proteínas se aumentó hasta 39 °C en un solo paso de diseño. [6]

Ejemplos

Un ejemplo temprano, involucró la estabilización de la transpeptidasa Sortase A que resultó en variantes estabilizadas por INCYPRO con actividad a temperatura elevada y en presencia de cloruro de guanidinio . [1] [5] INCYPRO también se ha aplicado para estabilizar el dominio KIX del adaptador humano utilizando diferentes moléculas reticulantes. Aquí, se observó una dependencia de la estabilidad de la proteína en la hidrofilicidad del enlace cruzado. [2] Además, se estabilizó una serie de complejos proteicos homotriméricos, incluida la esterasa de Pseudomonas fluorescens (PFE) y una Enoyl-CoA hidratasa . [6] En estos casos, se generaron conjugados enzimáticos con topología bicíclica general.

Véase también

Referencias

  1. ^ abcd Pelay-Gimeno M, Bange T, Hennig S, Grossmann TN (agosto de 2018). "Ciclización in situ de proteínas nativas: diseño basado en la estructura de una enzima bicíclica". Angewandte Chemie . 57 (35): 11164–11170. doi :10.1002/anie.201804506. PMC  6120448 . PMID  29847004.
  2. ^ ab Neubacher S, Saya JM, Amore A, Grossmann TN (febrero de 2020). "Ciclización in situ de proteínas (INCYPRO): la derivatización por enlaces cruzados modula la estabilidad de las proteínas". The Journal of Organic Chemistry . 85 (3): 1476–1483. doi :10.1021/acs.joc.9b02490. PMC 7011175 . PMID  31790232. 
  3. ^ Gligorijević V, Renfrew PD, Kosciolek T, Leman JK, Berenberg D, Vatanen T, et al. (mayo de 2021). "Predicción de la función de proteínas basada en la estructura utilizando redes convolucionales de grafos". Nature Communications . 12 (1): 3168. Bibcode :2021NatCo..12.3168G. doi :10.1038/s41467-021-23303-9. PMC 8155034 . PMID  34039967. 
  4. ^ Bornscheuer UT, Huisman GW, Kazlauskas RJ, Lutz S, Moore JC, Robins K (mayo de 2012). "Diseñando la tercera ola de biocatálisis". Nature . 485 (7397): 185–194. Código Bibliográfico :2012Natur.485..185B. doi :10.1038/nature11117. PMID  22575958. S2CID  4379415.
  5. ^ ab Kiehstaller S, Hutchins GH, Amore A, Gerber A, Ibrahim M, Hennig S, et al. (junio de 2023). "La sortasa A diseñada bicíclica realiza la transpeptidación en condiciones desnaturalizantes". Química bioconjugada . 34 (6): 1114–1121. doi :10.1021/acs.bioconjchem.3c00151. PMC 10288436 . PMID  37246906. 
  6. ^ abcd Hutchins GH, Kiehstaller S, Poc P, Lewis AH, Oh J, Sadighi R, et al. (febrero de 2024). "La biciclización covalente de complejos proteicos produce estructuras cuaternarias duraderas". Química . 10 (2): 615–627. Bibcode :2024Chem...10..615H. doi :10.1016/j.chempr.2023.10.003. PMC 10857811 . PMID  38344167.