En 1893 y por un año, intercambia su función con Theodore Dru Alison Cockerell (1866-1948) resultando conservador del Museo de Jamaica en Kingston.
En 1909, fue director de la Estación Experimental del Perú, función que conservó cuatro años.
Sucedió a Daniel William Coquillet (1856-1911) como taxónomo en el "Servicio de Entomología Nacional".
En 1919, comenzó un periodo de diez años donde Townsend principalmente trabajó en América del Sur: Perú, Brasil.
La abreviatura Townsend se emplea para indicar a Charles Henry Tyler Townsend como autoridad en la descripción y taxonomía en zoología.