Cenarqueo

Género de arqueas

Cenarchaeum es un género monotípico de arqueas de la familia Cenarchaeaceae . ^[2] La arquea marina Cenarchaeum symbiosum es psicrofílica y se encuentra habitando esponjas marinas. ^[3] Cenarchaeum symbiosum se detectó inicialmente como un importante microorganismo simbiótico que vive dentro (es un endosimbionte de) la esponja Axinella mexicana . ^[3] Se ha detectado de forma ubicua en los océanos del mundo en abundancias más bajas, mientras que en algunos géneros de esponjas marinas es uno de los miembros del microbioma más abundantes. Su secuencia y diversidad del genoma se han investigado en detalle encontrando productos metabólicos únicos y su papel en las actividades de oxidación del amoníaco.

Genoma

Se estima que el genoma de C. symbiosum tiene una longitud de 2,02 millones de pb, con una cantidad prevista de 2011 genes. ^[4]

Ecología

Cenarchaeum symbiosum es un organismo psicrófilo capaz de sobrevivir y proliferar a bajas temperaturas que suelen oscilar entre 7 y 19 grados Celsius. C. symbiosum tiene una relación simbiótica con ciertas variedades de especies de esponjas, que suelen vivir a profundidades de 10 a 20 metros, típicamente cerca de California.

Referencias

1. "Cenarchaeum Preston, Wu, Molinski & De Long, 1996". Fondo Mundial de Información sobre Biodiversidad . Consultado el 28 de abril de 2024 .
2. Véase la página web del NCBI sobre Cenarchaeum. Datos extraídos de "Recursos de taxonomía del NCBI". Centro Nacional de Información Biotecnológica . Consultado el 19 de marzo de 2007 .
3. Preston CM, Wu KY, Molinski TF, De Long EF (1996). "Un crenarqueón psicrofílico habita una esponja marina: Cenarchaeum symbiosum gen. nov., sp. nov". Proc. Natl. Sci. USA . 93 (13): 6241–6246. Bibcode :1996PNAS...93.6241P. doi : 10.1073/pnas.93.13.6241 . PMC 39006 . PMID  8692799. 
4. "Cenarchaeum symbiosum (Cenarchaeum symbiosum) Genome Browser Gateway". Puerta de enlace del navegador del genoma. Consultado el 25 de mayo de 2011 .

Lectura adicional

• Amin, Shady A; Moffett, James W; Martens-Habbena, Willm; Jaquot, Jeremy E; Han, Yang; Devol, Allan; Ingalls, Anitra E; Stahl, David A; Armbrust, E Virginia (noviembre de 2013). "Requerimientos de cobre de la arquea oxidante de amoníaco Nitrosopumilus maritimus SCM1 e implicaciones para la nitrificación en el ambiente marino". Limnología y Oceanografía . 58 (6): 2037–2045. Código Bibliográfico :2013LimOc..58.2037A. doi :10.4319/lo.2013.58.6.2037. S2CID  86826960.
• García-Bonilla, E., Brandão, PFB, Pérez, T., Junca, H. (2018), "Cenarchaeum symbiosum estable y enriquecido y Betaproteobacteria HF1 no cultivada en el microbioma de la esponja mediterránea Haliclona fulva (Demospongiae: Haplosclerida)", Microbial Ecology , 77 , Springer Science and Business Media LLC: 25–36, doi :10.1007/s00248-018-1201-5, PMID  29766224
• Hallam, Steven J; Konstantinidis, Konstantinos T; Putnam, Nik; Schleper, Christa; Watanabe, Yoh-ichi; Sugahara, Junichi; Preston, Christina; de la Torre, Jose; Richardson, Paul M; DeLong, Edward (28 de noviembre de 2006). "Análisis genómico del crenarqueote marino no cultivado Cenarchaeum symbiosum". Actas de la Academia Nacional de Ciencias . 103 (48): 18296–18301. Bibcode :2006PNAS..10318296H. doi : 10.1073/pnas.0608549103 . PMC  1643844 . PMID  17114289.
• Qin, W., Zheng, Y., Zhao, F., Wang, Y., Urakawa, H., Martens-Habbena, W., Liu, H., Huang, X., Zhang, X., Nakagawa, T., Mende, DR, Bollmann, A., Wang, B., Zhang, Y., Amin, SA, Nielsen, JL, Mori, K., Takahashi, R., Virginia Armbrust, E., Winkler, M.-KH, DeLong, EF, Li, M., Lee, P.-H., Zhou, J., Zhang, C., Zhang, T., Stahl, DA, Ingalls, AE (2020), "Estrategias alternativas de adquisición de nutrientes y mapa de conservación de energía para la biogeografía de arqueas marinas oxidantes de amoníaco", The ISME Journal , 14 (10), Oxford University Press (OUP): 2595–2609, Bibcode :2020ISMEJ..14.2595Q, doi :10.1038/s41396-020-0710-7, PMID  32636492
• Schleper, Christa; Swanson, Ronald V.; Mathur, Eric J.; Delong, Edward F. (diciembre de 1997). "Caracterización de una polimerasa de ADN de la arquea psicrofílica no cultivada Cenarchaeum symbiosum". Journal of Bacteriology . 179 (24): 7803–7811. doi :10.1128/jb.179.24.7803-7811.1997. PMC  179745 . PMID  9401041.
• Swan, Brandon K.; Martinez-Garcia, Manuel; Chaffin, Mark D.; Morrison, Hilary G.; Field, Erin K.; Poulton, Nicole J.; Masland, E. Dashiell P.; Harris, Christopher C.; Sczyrba, Alexander; Chain, Patrick SG; Koren, Sergey; Woyke, Tanja; Stepanauskas, Ramunas; et al. (17 de abril de 2014). "Diversidad metabólica y genómica de los taumarqueotas marinos del grupo I en la región mesopelágica de dos giros subtropicales". PLOS ONE . ​​9 (4): e95380. Bibcode :2014PLoSO...995380S. doi : 10.1371/journal.pone.0095380 . PMC  3990693 . PMID  24743558.
• Alves, RJE, Minh, BQ, Urich, T., Haeseler, A. von, Schleper, C. (2018), "Unificación de la filogenia global y la distribución ambiental de las arqueas oxidantes de amoníaco en función de los genes amoA", Nature Communications , 9 , Springer Science and Business Media LLC: 1517, Bibcode :2018NatCo...9.1517A, doi :10.1038/s41467-018-03861-1, PMC  5904100 , PMID  29666365