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Curva de Carlson

Costo total de secuenciar un genoma humano a lo largo del tiempo según cálculos del NHGRI .

La curva de Carlson es un término que describe la tasa de secuenciación de ADN o el costo por base secuenciada en función del tiempo. [1] Es el equivalente biotecnológico de la ley de Moore . Carlson predijo que el tiempo de duplicación de las tecnologías de secuenciación de ADN (medido por el costo y el rendimiento) sería al menos tan rápido como la ley de Moore. [2]

Historia

El término fue acuñado por The Economist [3] y lleva el nombre del autor Rob Carlson. [1]

Las curvas de Carlson ilustran las rápidas disminuciones (en algunos casos por encima del crecimiento exponencial ) de costos y los aumentos en el rendimiento de una variedad de tecnologías, incluyendo la secuenciación de ADN, la síntesis de ADN y una gama de herramientas físicas y computacionales utilizadas en la producción de proteínas y en la determinación de las estructuras de las proteínas .

Secuenciación de próxima generación

Sala de secuenciación en BGI Hong Kong, donde se muestran los secuenciadores Illumina Hiseq 2000

La Ley de Moore comenzó a quedar profundamente superada en enero de 2008 cuando los centros hicieron la transición de la secuenciación Sanger a tecnologías de secuenciación de ADN más nuevas: [4] secuenciación 454 con una longitud de lectura promedio de 300 a 400 bases (10 veces) secuenciación Illumina y SOLiD con una longitud de lectura promedio de 50 a 100 bases (30 veces).

Referencias

  1. ^ de Robert H. Carlson (abril de 2011). La biología es tecnología: la promesa, el peligro y el nuevo negocio de la ingeniería de la vida. Cambridge, MA: Harvard University Press .
  2. ^ Robert Carlson (septiembre de 2003). "El ritmo y la proliferación de las tecnologías biológicas". Bioseguridad y bioterrorismo: estrategia, práctica y ciencia de la biodefensa . 1 (3: 203–214): 203–214. doi :10.1089/153871303769201851. PMID  15040198.
  3. ^ "Vida 2.0". The Economist. 31 de agosto de 2006.
  4. ^ "Costos de secuenciación de ADN". Instituto Nacional de Investigación del Genoma Humano .