El Campeonato Japonés de Fórmula 3000 de 1988 se disputó en 8 rondas. Compitieron 18 equipos diferentes, 24 pilotos diferentes, 5 chasis diferentes y 3 motores diferentes.
En cada carrera se otorgaron puntos: 9 puntos al ganador, 6 al segundo, 4 al tercer lugar, 3 al cuarto lugar, 2 al quinto lugar y 1 al sexto lugar. No se otorgaron puntos adicionales. Los 6 mejores resultados cuentan. A dos pilotos se les descontó un punto, que se indica en ().
R = jubilado NS = no inició NQ = no calificó