El tercer nivel del sistema de ligas de fútbol boliviano consta de nueve ligas regionales (una por cada departamento ); el número de participantes varía según
del departamento. Suele contar con entre 8 y 12 equipos. El ganador y el subcampeón de cada liga compiten en la Copa Simón Bolívar, en la que el ganador de dicho torneo obtiene el ascenso a la 1.ª División , y el subcampeón juega un partido de desempate con los dos últimos equipos ubicados en la Primera División . Hasta 1976, los 8 campeonatos regionales ( Pando no tenía un torneo organizado en ese momento) eran la máxima división de la pirámide del fútbol nacional, y el ganador de la Copa Simón Bolívar era coronado campeón nacional.
El campeonato regional más antiguo es el que se juega en La Paz. Se inició en 1914 y fue considerado durante muchos años como la máxima liga boliviana, especialmente cuando se convirtió en un torneo semiprofesional en 1950 y comenzó a incluir equipos de Oruro y Cochabamba .
El torneo se inició en 1960. Inicialmente, participaron sólo los campeones de La Paz, Cochabamba, Oruro y Santa Cruz. En años posteriores, se sumaron equipos de otras asociaciones y, finalmente, el torneo también contó con la participación de los subcampeones.
Hasta 1976, ante la falta de una liga nacional, la copa determinaba el campeón nacional y los equipos representativos para la Copa Libertadores . Con la creación de la Liga de Fútbol Profesional Boliviano , la Asociación Boliviana de Fútbol dejó de organizar el torneo.
En 1989, el torneo resucitó, con el mismo formato de campeones y subcampeones de cada asociación, pero esta vez cada liga regional era el segundo nivel en la pirámide del fútbol, por lo que se suponía que el campeón obtenía un lugar en la liga profesional. Anteriormente, el último equipo ubicado en la 1.ª división era reemplazado por el campeón regional de su departamento. Sin embargo, esa práctica se mantuvo hasta 1993, cuando finalmente el campeón obtenía un lugar en la liga superior.
El formato de la competición cambia con frecuencia. En 2008, los equipos se dividieron en tres grupos de seis equipos, para ahorrar costos. Se formaron equipos geográficamente cercanos y jugaron todos contra todos, quedando el grupo 1 formado por equipos de La Paz, Oruro y Cochabamba; el grupo 2 por equipos de Potosí, Chuquisaca y Tarija, y el grupo 3 por equipos de Santa Cruz, Beni y Pando. Los dos primeros equipos avanzaron a la siguiente ronda, en la que se jugaron play-offs en modalidad de ida y vuelta, y los tres ganadores y el mejor perdedor avanzaron a las semifinales y luego a la final.
La LFPB anunció que, debido al cambio de fútbol en la Primera División, la Copa Simón Bolívar sería reemplazada por la Liga Nacional B que consta de trece clubes, los campeones de cada departamento a excepción de Tarija que tendría dos clubes (Campeón y Subcampeón), los dos últimos equipos descendidos de Primera división y los ganadores del Torneo Nacional Provincial. La Asociación de Fútbol de La Paz y el Campeonato de la Asociación de Fútbol de Oruro se opusieron a este cambio, sin embargo la Asociación Nacional de Fútbol y la Federación Boliviana de Fútbol aprobaron este cambio en el Fútbol Boliviano .
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1989 hasta el presente
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