El Campeonato Sueco de Natación en Piscina Corta de 2006 se celebró en Fyrishov , Uppsala, del 23 al 26 de noviembre de 2006. Se declararon 44 campeones y se establecieron tres récords nacionales, ocho récords nacionales juveniles, 16 récords de campeonato y siete récords nacionales de relevos de clubes.