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TANGO2

El homólogo de transporte y organización de Golgi 2 (TANGO2), también conocido como marco de lectura abierto 25 del cromosoma 22 (C22orf25), es una proteína que en los humanos está codificada por el gen TANGO2.

La función de C22orf25 no se conoce actualmente. Se caracteriza por el dominio de la superfamilia NRDE (DUF883), que se conoce estrictamente por la secuencia conservada de aminoácidos de (N)- Asparagina (R)- Arginina (D)- Ácido aspártico (E)- Ácido glutámico . Este dominio se encuentra entre especies distantemente relacionadas de los seis reinos: [4] Eubacteria , Archaebacteria , Protista , Fungi , Plantae y Animalia y se sabe que está involucrado en la organización de Golgi y la secreción de proteínas. [5] Es probable que se localice en el citoplasma , pero está anclado en la membrana celular por el segundo aminoácido. [6] [7] C22orf25 también es xenólogo a proteínas similares a T10 en el virus de la viruela aviar y el virus de la viruela del canario . El gen que codifica C22orf25 se encuentra en el cromosoma 22 y en la localización q11.21, por lo que suele asociarse al síndrome de deleción 22q11.2 . [8]

Proteína

Barrio genético

El gen C22orf25 se encuentra en el brazo largo (q) del cromosoma 22 en la región 1, banda 1 y subbanda 2 (22q11.21) comenzando en 20.008.631 pares de bases y terminando en 20.053.447 pares de bases. [8] Hay una deleción de 1,5-3,0 Mb que contiene alrededor de 30-40 genes , que abarca esta región que causa el trastorno de deleción genética más sobrevivible conocido como síndrome de deleción 22q11.2 , que se conoce más comúnmente como síndrome de DiGeorge o síndrome velocaridofacial. [12] [13] El síndrome de deleción 22q11.2 tiene una amplia gama de fenotipos y no se atribuye a la pérdida de un solo gen. Los vastos fenotipos surgen de deleciones no solo de genes de la región crítica del síndrome de DiGeorge (DGCR) y de genes de enfermedades, sino también de otros genes no identificados. [14]

C22orf25 está muy cerca de DGCR8, así como de otros genes que se sabe que desempeñan un papel en el síndrome de DiGeorge, como el gen de repetición de armadillo eliminado en el síndrome velocardiofacial ( ARVCF ), la catecol-O-metiltransferasa ( COMT ) y la T-box 1 ( TBX1 ). [15] [16]

Vecindario genético de C22orf25

Características previstas del ARNm

Promotor

El promotor del gen C22orf25 abarca 687 pares de bases desde 20.008.092 hasta 20.008.878 con un sitio de inicio de transcripción previsto de 104 pares de bases y abarca desde 20.008.591 hasta 20.008.694. [17] La ​​región promotora y el comienzo del gen C22orf25 (20.008.263 a 20.009.250) no se conservan más allá de los primates. Esta región se utilizó para determinar las interacciones de los factores de transcripción .

Factores de transcripción

A continuación se enumeran algunos de los principales factores de transcripción que se unen al promotor. [18]

Análisis de expresión

Los datos de expresión del mapeo de etiquetas de secuencia expresada , microarrays e hibridación in situ muestran una alta expresión de Homo sapiens en la sangre , la médula ósea y los nervios . [19] [20] [21] La expresión no está restringida a estas áreas y se observa una baja expresión en otras partes del cuerpo. En Caenorhabditis elegans , el gen snt-1 (homólogo C22orf25) se expresó en el anillo nervioso, los procesos del cordón ventral y dorsal, los sitios de las uniones neuromusculares y en las neuronas. [22]

Historia evolutiva

El dominio NRDE (DUF883) es un dominio de función desconocida que abarca la mayoría del gen C22orf25 y se encuentra entre especies distantemente relacionadas, incluidos los virus.

Características de las proteínas previstas

Modificaciones postraduccionales

Las modificaciones postraduccionales del gen C22orf25 que se conservan evolutivamente en los reinos Animalia y Plantae, así como en el virus de la viruela del canario, incluyen la glicosilación (C-manosilación), [23] la glicación , [24] la fosforilación (específica de la quinasa), [25] y la palmitoilación . [26]

Topología prevista

El C22orf25 se localiza en el citoplasma y se ancla a la membrana celular mediante el segundo aminoácido. Como se mencionó anteriormente, el segundo aminoácido se modifica mediante palmitoilación. Se sabe que la palmitoilación contribuye a la asociación de la membrana [27] porque contribuye a una mayor hidrofobicidad. [6] Se sabe que la palmitoilación desempeña un papel en la modulación del tráfico de proteínas, [28] la estabilidad [29] y la clasificación. [30] La palmitoilación también está involucrada en la señalización celular [31] y la transmisión neuronal. [32]

Interacciones de proteínas

Se ha demostrado que C22orf25 interactúa con NFKB1 , [33] RELA , [33] RELB , [33] BTRC , [33] RPS27A , [33] BCL3 , [33] MAP3K8 , [33] NFKBIA , [33] SIN3A , [33] SUMO1 , [33] Tat . [34]

Importancia clínica

Las mutaciones en el gen TANGO2 pueden causar defectos en la β-oxidación mitocondrial [35] y un mayor estrés del retículo endoplásmico y una reducción en la densidad del volumen de Golgi . [36] Estas mutaciones dan como resultado una aparición temprana de hipoglucemia , hiperamonemia , rabdomiólisis , arritmias cardíacas y encefalopatía que luego se convierte en deterioro cognitivo. [35] [36] La autofagia y mitofagia anormales se han asociado con la enfermedad relacionada con TANGO2 y pueden explicar la presentación variable en las biopsias musculares, incluido el metabolismo anormal secundario de ácidos grasos y mitocondrial. [37]

Referencias

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