El evento masculino C-2 de 1000 metros fue un evento de piragüismo por parejas de estilo abierto realizado como parte del programa de piragüismo en los Juegos Olímpicos de Verano de 1964 en el lago Sagami , Japón .
Las eliminatorias preliminares se llevaron a cabo el 20 de octubre de 1964; Participaron 12 equipos y se dividieron en dos series de 6 parejas cada una. Los tres primeros clasificados de cada serie avanzaron a la final, mientras que los seis equipos restantes tuvieron que competir en una semifinal que se celebró al día siguiente. Los 3 piragüistas más lentos fueron eliminados en la semifinal el 21 de octubre, y los 3 primeros se unieron a los 6 finalistas iniciales. La final se celebró el 22 de octubre.
Los 12 equipos compitieron por primera vez en dos eliminatorias el 20 de octubre. Los tres primeros clasificados de cada una de las eliminatorias avanzaron directamente a la final y los 6 equipos restantes descendieron a la semifinal.
Los tres primeros clasificados de la semifinal (disputada el 21 de octubre) avanzaron a la final, uniéndose a los seis equipos que habían pasado directamente de las eliminatorias. Todos los demás equipos fueron eliminados.
La final se celebró el 22 de octubre. Los tres medallistas, e incluso los cuartos clasificados, vinieron de la primera serie.