Bruce Randall Donald (nacido en 1958) es un científico informático y biólogo computacional estadounidense . Es profesor de Ciencias de la Computación y Bioquímica de la Universidad de Duke . Ha realizado numerosas contribuciones en varios campos de la informática , como la robótica , los sistemas microelectromecánicos (MEMS), los algoritmos geométricos y físicos y la geometría computacional , así como en áreas de biología molecular estructural y bioquímica como el diseño de proteínas , la determinación de la estructura de proteínas y la química computacional .
Donald recibió una licenciatura summa cum laude en Lengua y Literatura Rusa de la Universidad de Yale en 1980. Después de trabajar en el Laboratorio de Gráficos Informáticos y Análisis Espacial en la Escuela de Graduados de Diseño de la Universidad de Harvard , asistió a MIT EECS , donde recibió su maestría en EECS (1984) y su doctorado en Ciencias de la Computación (1987) bajo la supervisión del profesor Tomás Lozano-Pérez en el MIT AI Lab (Laboratorio de Inteligencia Artificial). [1] Se unió al Departamento de Ciencias de la Computación de la Universidad de Cornell como profesor asistente en 1987.
En Cornell, Donald recibió la titularidad en 1993 y se desempeñó como profesor asociado de informática en la Universidad de Cornell hasta 1998. Mientras estaba en un año sabático en la Universidad de Stanford (1994-1996), trabajó en la incubadora de investigación y desarrollo y tecnología de Paul Allen , Interval Research Corporation (1995-1997), donde él y Tom Ngo co-inventaron los gráficos de restricciones integrados. [2] [3] Después de mudarse a Dartmouth, Donald fue profesor Joan P. y Edward J. Foley Jr 1933 de informática en el Dartmouth College hasta 2006, cuando se mudó a la Universidad de Duke . Actualmente, Donald es profesor James B. Duke de informática, química y bioquímica en el Trinity College of Arts and Sciences de la Universidad de Duke y en la Facultad de Medicina del Centro Médico de la Universidad de Duke . Donald fue nombrado profesor William y Sue Gross de 2006 a 2012, y fue nombrado profesor James B. Duke en 2012. [4]
Es miembro de la Association for Computing Machinery (ACM) y del IEEE . Anteriormente, fue becario Guggenheim (2001-2002) y recibió un premio presidencial de la National Science Foundation para jóvenes investigadores ( 1989-1994). En 2015, Donald fue elegido miembro de la American Association for the Advancement of Science (AAAS) por sus contribuciones a la biología molecular computacional . [5]
Las primeras investigaciones de Donald se centraron en el campo de la planificación del movimiento robótico y la manipulación distribuida. [6] Posteriormente realizó numerosas contribuciones a los MEMS y la microrrobótica, y diseñó microrobots MEMS con dimensiones de 60 μm por 250 μm por 10 μm. [7]
Recientemente, ha realizado investigaciones en las áreas de Biología Molecular Estructural; principalmente, Diseño de Proteínas y Determinación de Estructura de Proteínas a partir de datos de RMN . Ha desarrollado numerosos algoritmos para el diseño de proteínas que se han probado con éxito experimentalmente en el laboratorio húmedo. [8] Los algoritmos de diseño de proteínas intentan incorporar flexibilidad molecular adicional en el proceso de diseño mediante el uso de conjuntos y rotámeros y cadenas principales continuamente flexibles. Donald también ha desarrollado algoritmos para determinar las estructuras de proteínas biomédicamente significativas. Por ejemplo, su algoritmo de subgrupo CRANS (Acta Crystallogr. D 2004; J. Biol. Chem. 2003), que identifica picos de rotación cruzada consistentes con simetría no cristalográfica, se utilizó en la determinación de la estructura de la enzima dihidrofolato reductasa-timidilato sintasa (DHFR-TS) de Cryptosporidium hominis , un avance importante en la biología de Cryptosporidium. Ha diseñado numerosos algoritmos y protocolos computacionales para extraer información estructural de datos de RMN, y ha utilizado esa información para calcular estructuras de proteínas globulares y homooligómeros simétricos. Una característica distintiva de sus algoritmos es que utilizan menos datos y proporcionan garantías de teoría de la complejidad en el tiempo y el espacio (véase, por ejemplo, BR Donald y J. Martin. "Automated NMR Assignment and Protein Structure Determination using Sparse Dipolar Coupling Constraints". Progress in NMR Spectroscopy 2009; 55(2):101-127). Donald es el autor de Algorithms in Structural Molecular Biology, un libro de texto publicado por MIT Press (2011).
Donald ha supervisado a muchos estudiantes y posdoctorados, muchos de los cuales ahora son profesores en universidades de renombre como el MIT , la Universidad Carnegie-Mellon , la Universidad de Washington, Seattle , la Universidad de Massachusetts Amherst , el Dartmouth College , la Universidad de Duke , el Middlebury College y la Universidad de Toronto , e investigadores en organizaciones como NIAID , NIST , IBM y Sandia National Laboratories . [9]
Donald es hijo del historiador David Herbert Donald y de la historiadora y editora Aida DiPace Donald . [10]
Donald es autor de más de 100 publicaciones. Una selección representativa incluye: