Publicó numerosas obras sobre mamíferos, aves, y peces.
Para esos propósitos, Bocage estandarizó los procedimientos para colectar, preparar y enviar especímenes al Museo, en su texto Instrucções Practicas sobre o Modo de Colligir, Preparar e Remetter Productos Zoológicos para o Museu de Lisboa (1862).
En 1860, tuvo éxito en volver a tener algunas colecciones que habían sido retiradas del Museo durante la invasión napoleónica de Portugal por obra del naturalista francés Étienne Geoffroy Saint-Hilaire (1772–1844), que incluyeron muestras de alto valor recolectados por el portugués Alexandre Rodrigues Ferreira (1756–1815) en Brasil.
José Vicente era primo segundo del poeta Manuel Maria Barbosa de Bocage (1765–1805).
La abreviatura Barbosa du Bocage se emplea para indicar a José Vicente Barbosa du Bocage como autoridad en la descripción y taxonomía en zoología.