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Base de datos espectral para compuestos orgánicos

La base de datos espectral para compuestos orgánicos ( SDBS ) es una base de datos de búsqueda en línea gratuita alojada por el Instituto Nacional de Ciencia y Tecnología Industrial Avanzada (AIST) en Japón, que contiene datos espectrales de aproximadamente 34.000 moléculas orgánicas. [1] La base de datos está disponible en inglés y japonés e incluye seis tipos de espectros: espectros láser Raman , espectros de masas de ionización electrónica (EI-MS), espectros infrarrojos por transformada de Fourier (FT-IR), resonancia magnética nuclear 1 H. ( 1 H-NMR), espectros de resonancia magnética nuclear de 13 C ( 13 C-NMR) y espectros de resonancia paramagnética electrónica (EPR). [2] La construcción de la base de datos comenzó en 1982. La mayoría de los espectros fueron adquiridos y registrados en AIST y algunas de las colecciones aún se están actualizando. [3] Desde 1997, se puede acceder a la base de datos de forma gratuita, pero su uso requiere aceptar una exención de responsabilidad; el número total acumulado de veces accedidas alcanzó los 550 millones a finales de enero de 2015. [4]

Contenido

Espectros láser Raman

La base de datos contiene aproximadamente 3500 espectros Raman. Los espectros se registraron en la región de 4000 – 0 cm −1 con una longitud de onda de excitación de 4800 nm y un ancho de rendija de 100 – 200 micrómetros. Esta colección no se está actualizando. [4]

Espectros de masas de ionización electrónica (EI-MS)

Los espectros EI-MS se midieron en un espectrómetro JEOL JMS-01SG o JEOL JMS-700, mediante el método de ionización electrónica, con un voltaje de aceleración electrónica de 75 eV y un voltaje de aceleración de iones de 8 – 10 kV. Se utilizaron los sistemas de entrada directa o de embalse. La precisión del número de masa es 0,5. Esta colección contiene ca. 25.000 espectros EI-MS y se está actualizando. [4]

Espectros infrarrojos por transformada de Fourier (FT-IR)

Los espectros FT-IR se registraron utilizando un espectrómetro Nicolet 170SX o JASCO FT/IR-410. Para los espectros registrados en el espectrómetro Nicolet, los datos se almacenaron a intervalos de 0,5 cm −1 en la región de 4.000 – 2.000 cm −1 y de 0,25 cm −1 en la región de 2.000 – 400 cm −1 y la resolución espectral fue de 0,25 cm. −1 . Para los espectros registrados en el espectrómetro JASCO, la resolución y los intervalos fueron de 0,5 cm −1 . Las muestras de sólidos se prepararon utilizando el método de disco KBr o pasta de Nujol , las muestras de líquidos se prepararon con el método de película líquida . Esta colección contiene aproximadamente 54.100 espectros y se está actualizando. [4]

1Espectros de H RMN

Los espectros de 1 H NMR se registraron a una frecuencia de resonancia de 400 MHz con una resolución de 0,0625 Hz o a 90 MHz con una resolución de 0,125 Hz. La adquisición espectral se llevó a cabo utilizando un ángulo de giro de 22,5 – 30,0 grados y un tiempo de repetición del pulso de 30 segundos. [4] Las muestras se prepararon mediante disolución en cloroformo deuterado (CDCl 3 ), óxido de deuterio (D 2 O) o dimetilsulfóxido deuterado (DMSO-d 6 ). [5] Cada espectro va acompañado de una lista de picos con sus respectivas intensidades y cambios químicos informados en ppm y en Hz. La mayoría de los espectros muestran la asignación de picos. Esta colección contiene aproximadamente 15.900 espectros y se está actualizando. [4]

13Espectros de RMN C

Los espectros de 13 C NMR se registraron en varios espectrómetros con frecuencias de resonancia que oscilaban entre 15 MHz y 100 MHz y una resolución que oscilaba entre 0,025 y 0,045 ppm. Los espectros se adquirieron utilizando un ángulo de inversión del pulso de 22,5 a 45 grados y un tiempo de repetición del pulso de 4 a 7 segundos. [4] Las muestras se prepararon mediante disolución en CDCl 3 , D 2 O o DMSO-d 6 . [5] Cada espectro va acompañado de una lista de los picos observados con sus respectivos cambios químicos en ppm y sus intensidades. La mayoría de los espectros muestran la asignación de picos. Esta colección contiene aproximadamente 14.200 espectros y se está actualizando. [4]

Espectros de resonancia paramagnética electrónica (EPR)

Esta colección contiene aproximadamente 2.000 espectros. Las condiciones de medición y la preparación de la muestra se describen para cada espectro en particular. Esta colección dejó de actualizarse en 1987. [4]

Buscando en la base de datos

Búsquedas directas

Se puede buscar en la base de datos ingresando uno o más de los siguientes parámetros: nombre químico (es posible solicitar una coincidencia parcial o completa), fórmula molecular , número de diferentes tipos de átomos presentes en la molécula (como un valor único o como un rango de valores), peso molecular (como un valor único o como un rango de valores), número de registro CAS o número SDBS. En todos los casos se pueden utilizar “%” o “*” como comodines. El resultado de la búsqueda incluye todos los espectros disponibles para los parámetros de búsqueda ingresados. Los resultados se pueden ordenar por peso molecular, número de carbonos o número de SDBS en orden ascendente o descendente. [6]

Búsquedas inversas

Si se dispone de un espectro de un compuesto químico desconocido, se puede realizar una búsqueda inversa ingresando los valores del desplazamiento químico, la frecuencia o la masa de los picos en el espectro de RMN, FT-IR o EI-MS respectivamente. Este tipo de búsqueda permite obtener en la base de datos todos los compuestos químicos que tengan las características espectrales introducidas. [6]

Referencias

  1. ^ Wagner, AB (2014). "Capítulo 6: Propiedades físicas y espectros". En Currano, J.; Roth, D. (eds.). Información química para químicos: introducción . Real Sociedad de Química. págs. 170-171. ISBN 978-1-84973-551-3.
  2. ^ Tanabe, K.; Hayamizu, K.; Ono, S.; Wasada, N.; Someno, K; Nokana, S.; Inazumi, Y. (1991). "Sistema de base de datos espectral SDBS en PC con CD-ROM". Ciencias Analíticas . 7 (suplementario): 711–712. doi : 10.2116/analsci.7.Supple_711 .
  3. ^ "Introducción a la base de datos espectral (SDBS)". Araña química . Real Sociedad de Química . Consultado el 19 de diciembre de 2017 .
  4. ^ abcdefghi "Introducción a la base de datos espectral (SDBS)". Base de datos espectral para compuestos orgánicos, SDBS . Instituto Nacional de Ciencia y Tecnología Industrial Avanzada (AIST) . Consultado el 19 de diciembre de 2017 .
  5. ^ ab Tsai, CS (2002). Una introducción a la bioquímica computacional . Nueva York: Wiley-Liss, Inc. págs. 95–98. ISBN 0-471-40120-X.
  6. ^ ab "Compuestos SDBS y búsqueda espectral". Base de datos espectral para compuestos orgánicos, SDBS . Instituto Nacional de Ciencia y Tecnología Industrial Avanzada (AIST) . Consultado el 21 de diciembre de 2017 .

enlaces externos