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Gen codificador de proteínas en la especie Homo sapiens

El factor de unión al andamio B , también conocido como SAFB , es un gen con homólogos que se han estudiado en humanos y ratones. ^[5]

Función

Este gen codifica una proteína de unión al ADN que tiene especificidad para los elementos de ADN de la región de unión a la matriz o al andamiaje (ADN S/MAR). Se cree que esta proteína está involucrada en la unión de la base de los bucles de cromatina a la matriz nuclear, pero existen opiniones contradictorias sobre si esta proteína es un componente de la cromatina, la matriz nuclear o ambas. Los factores de unión al andamiaje son un subconjunto de las proteínas de la matriz nuclear (NMP) con una unión enriquecida a secuencias S/MAR ricas en AT. Se cree que la proteína SAF-B sirve como base molecular para ensamblar un "complejo transcriptosomal" en la proximidad de los genes transcritos activamente. Está involucrada en la regulación de la transcripción de la proteína de choque térmico 27 ​​y también puede actuar como un correpresor del receptor de estrógeno. Este gen es un gen candidato para la tumorigénesis mamaria. ^[5]

Interacciones

Se ha demostrado que SAFB interactúa con:

• Receptor de estrógeno alfa , ^{[6] [7]}
• Departamento de Policía Nacional del Reino Unido , ^[8]
• SAFB2 , ^[9] y
• TAF15 . ^[6]

Referencias

1. GRCh38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSG00000160633 – Ensembl , mayo de 2017
2. GRCm38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSMUSG00000071054 – Ensembl , mayo de 2017
3. "Referencia de PubMed humana:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
4. "Referencia PubMed de ratón:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU . .
5. "Entrez Gene: factor de unión al andamio SAFB B".
6. Townson SM, Kang K, Lee AV, Oesterreich S (junio de 2004). "Análisis de la estructura y la función del factor de unión al andamiaje del correpresor del receptor de estrógeno alfa-B1: identificación de un dominio de represión transcripcional potente". J. Biol. Chem . 279 (25): 26074–81. doi : 10.1074/jbc.M313726200 . PMID  15066997.
7. Oesterreich S, Zhang Q, Hopp T, Fuqua SA, Michaelis M, Zhao HH, Davie JR, Osborne CK, Lee AV (marzo de 2000). "El receptor de estrógeno (ER) unido al tamoxifeno interactúa fuertemente con la proteína de matriz nuclear HET/SAF-B, un nuevo inhibidor de la transactivación mediada por ER". Mol. Endocrinol . 14 (3): 369–81. doi : 10.1210/mend.14.3.0432 . PMID  10707955.
8. Arao Y, Kuriyama R, Kayama F, Kato S (agosto de 2000). "Un factor asociado a la matriz nuclear, SAF-B, interactúa con isoformas específicas de AUF1/hnRNP D". Arco. Bioquímica. Biofísica . 380 (2): 228–36. doi :10.1006/abbi.2000.1938. PMID  10933876.
9. Townson SM, Dobrzycka KM, Lee AV, Air M, Deng W, Kang K, Jiang S, Kioka N, Michaelis K, Oesterreich S (mayo de 2003). "SAFB2, un nuevo homólogo del factor de unión al andamiaje y correpresor del receptor de estrógeno". J. Biol. Chem . 278 (22): 20059–68. doi : 10.1074/jbc.M212988200 . PMID  12660241.

Lectura adicional

• Oesterreich S (2004). "Factores de unión de andamios SAFB1 y SAFB2: ¿espectadores inocentes o actores críticos en la tumorogénesis mamaria?". J. Cell. Biochem . 90 (4): 653–61. doi :10.1002/jcb.10685. PMID  14587024. S2CID  39178501.
• Romig H, Fackelmayer FO, Renz A, Ramsperger U, Richter A (1992). "Caracterización de SAF-A, una nueva proteína de unión al ADN nuclear de células HeLa con alta afinidad por elementos de ADN de unión a la matriz/andamio nuclear". EMBO J . 11 (9): 3431–40. doi :10.1002/j.1460-2075.1992.tb05422.x. PMC  556878 . PMID  1324173.
• Renz A, Fackelmayer FO (1996). "Purificación y clonación molecular del factor de unión al andamiaje B (SAF-B), una nueva proteína nuclear humana que se une específicamente al ADN S/MAR". Nucleic Acids Res . 24 (5): 843–9. doi :10.1093/nar/24.5.843. PMC  145707 . PMID  8600450.
• Oesterreich S, Lee AV, Sullivan TM, Samuel SK, Davie JR, Fuqua SA (1997). "La nueva proteína de matriz nuclear HET se une al promotor HSP27 e influye en su actividad en células de cáncer de mama humano". J. Cell. Biochem . 67 (2): 275–86. doi :10.1002/(SICI)1097-4644(19971101)67:2<275::AID-JCB13>3.0.CO;2-E. PMID  9328833. S2CID  29247141.
• DuPont BR, Garcia DK, Sullivan TM, Naylor SL, Oesterreich S (1998). "Asignación de SAFB que codifica la proteína de unión a ERE-TATA (HET) de Hsp27/factor de unión al andamiaje B (SAF-B) a la banda p13 del cromosoma 19 humano". Cytogenet. Cell Genet . 79 (3–4): 284–5. doi :10.1159/000134744. PMID  9605873.
• Nayler O, Strätling W, Bourquin JP, Stagljar I, Lindemann L, Jasper H, Hartmann AM, Fackelmayer FO, Ullrich A, Stamm S (1998). "La proteína SAF-B acopla la transcripción y el empalme del pre-ARNm a elementos SAR/MAR". Nucleic Acids Res . 26 (15): 3542–9. doi :10.1093/nar/26.15.3542. PMC  147731 . PMID  9671816.
• Weighardt F, Cobianchi F, Cartegni L, Chiodi I, Villa A, Riva S, Biamonti G (1999). "Una nueva proteína hnRNP (HAP/SAF-B) ingresa a un subconjunto de complejos hnRNP y se reubica en gránulos nucleares en respuesta al choque térmico". J. Cell Sci . 112 (10): 1465–76. doi :10.1242/jcs.112.10.1465. PMID  10212141.
• Oesterreich S, Zhang Q, Hopp T, Fuqua SA, Michaelis M, Zhao HH, Davie JR, Osborne CK, Lee AV (2000). "El receptor de estrógeno (ER) unido al tamoxifeno interactúa fuertemente con la proteína de matriz nuclear HET/SAF-B, un nuevo inhibidor de la transactivación mediada por ER". Mol. Endocrinol . 14 (3): 369–81. doi : 10.1210/mend.14.3.0432 . PMID  10707955.
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• Arao Y, Kuriyama R, Kayama F, Kato S (2000). "Un factor asociado a la matriz nuclear, SAF-B, interactúa con isoformas específicas de AUF1/hnRNP D". Arco. Bioquímica. Biofísica . 380 (2): 228–36. doi :10.1006/abbi.2000.1938. PMID  10933876.
• Stoss O, Olbrich M, Hartmann AM, Konig H, Memmott J, Andreadis A, Stamm S (2001). "La proteína rSLM-2 de la familia STAR/GSG regula la selección de sitios de empalme alternativos". J. Biol. Chem . 276 (12): 8665–73. doi : 10.1074/jbc.M006851200 . PMID  11118435.
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• Nikolakaki E, Kohen R, Hartmann AM, Stamm S, Georgatsou E, Giannakouros T (2001). "Clonación y caracterización de una forma alternativamente empalmada de la proteína quinasa SR 1 que interactúa específicamente con el factor de unión al andamiaje B". J. Biol. Chem . 276 (43): 40175–82. doi : 10.1074/jbc.M104755200 . PMID  11509566.
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• Tai HH, Geisterfer M, Bell JC, Moniwa M, Davie JR, Boucher L, McBurney MW (2003). "CHD1 se asocia con NCoR y la histona desacetilasa, así como con proteínas de empalme de ARN". Biochem. Biophys. Res. Commun . 308 (1): 170–6. doi :10.1016/S0006-291X(03)01354-8. PMID  12890497.
• Li J, Hawkins IC, Harvey CD, Jennings JL, Link AJ, Patton JG (2003). "Regulación del empalme alternativo por SRrp86 y sus proteínas interactuantes". Mol. Cell. Biol . 23 (21): 7437–47. doi : 10.1128 /MCB.23.21.7437-7447.2003. PMC  207616. PMID  14559993.