Familia AGCS

Familia de proteínas transportadoras

Los miembros de la familia AGCS (TC# 2.A.25) transportan alanina y/o glicina en simporte con Na ⁺ y/o H ⁺ .

Estructura y función

Las proteínas conocidas de la familia AGCS tienen entre 445 y 550 residuos de aminoacilo de longitud y poseen de 8 a 12 supuestas cadenas transmembrana α-helicoidales. Los miembros pueden poseer 11 segmentos transmembrana (TMS), como parece ser cierto para DagA (TC# 2.A.25.1.1) y AgcS (TC# 2.A.25.1.3), aunque Acp (TC# 2.A.25.1.2) tiene solo 8 TMS, tal vez como resultado del truncamiento. A principios de 2016, no parece haber datos de estructura cristalina 3D disponibles para estas proteínas. Se han encontrado miembros de la familia AGCS en bacterias y arqueas, como la cianobacteria halotolerante extremófila Aphanothece halophytica y la bacteria termófila Bacillus PS3 . ^{[1] [2]} Hasta 2015, solo se han caracterizado funcionalmente tres miembros de la familia. Estas proteínas muestran una similitud de secuencia limitada en la familia APC (TC# 2.A.3). ^[3] Las estructuras de alta resolución de AgcS de Methanococcus maripaludis se obtuvieron mediante cristalografía de rayos X y se publicaron en 2019 y muestran homología estructural con otros miembros de la superfamilia de transportadores de aminoácidos, poliaminas y organocationes . ^[4]

Reacción de transporte

La reacción de transporte generalizada catalizada por la familia AGCS es: ^[3]

alanina o glicina (salida) + Na ⁺ o H ⁺ (salida) → alanina o glicina (entrada) + Na ⁺ o H ⁺ (entrada).

Proteínas de la familia AGCS

Actualmente existen 10 proteínas pertenecientes a la familia AGCS. Estas proteínas y sus descripciones se pueden encontrar en la base de datos de clasificación de transportadores.

Referencias

1. Bualuang A, Kageyama H, Tanaka Y, Incharoensakdi A, Takabe T (2015). "Caracterización funcional de un miembro de la familia de simportadores de cationes alanina o glicina en la cianobacteria halotolerante Aphanothece halophytica". Biociencia, biotecnología y bioquímica . 79 (2): 230–5. doi : 10.1080/09168451.2014.968091 . PMID  25421789. S2CID  205616830.
2. Kanamori M, Kamata H, Yagisawa H, Hirata H (marzo de 1999). "Sobreexpresión del gen de la proteína portadora de alanina de la bacteria termófila PS3 en Escherichia coli". Revista de Bioquímica . 125 (3): 454–9. doi : 10.1093/oxfordjournals.jbchem.a022308. PMID  10050032.
3. Saier MH. "2.A.25 La familia de transportadores simportadores de cationes alanina o glicina (AGCS)". Base de datos de clasificación de transportadores . Grupo de bioinformática del laboratorio Saier / SDSC.
4. Ma J, Lei HT, Reyes FE, Sanchez-Martinez S, Sarhan MF, Hattne J, Gonen T (febrero de 2019). "Base estructural para la unión del sustrato y especificidad de un simportador de sodio-alanina AgcS". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 116 (6): 2086–2090. Bibcode :2019PNAS..116.2086M. doi : 10.1073/pnas.1806206116 . PMC 6369739 . PMID  30659158. 

Lectura adicional

• Rodionov DA, Hebbeln P, Eudes A, ter Beek J, Rodionova IA, Erkens GB, et al. (Enero de 2009). "Una nueva clase de transportadores modulares de vitaminas en procariotas". Revista de Bacteriología . 191 (1): 42–51. doi :10.1128/JB.01208-08. PMC  2612444 . PMID  18931129.
• Kamata H, Akiyama S, Morosawa H, Ohta T, Hamamoto T, Kambe T, et al. (octubre de 1992). "Estructura primaria de la proteína portadora de alanina de la bacteria termófila PS3". La Revista de Química Biológica . 267 (30): 21650–5. doi : 10.1016/S0021-9258(19)36661-X . PMID  1400476.

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