Especies de bacteria
Arthrobacter agilis es una especie de bacteria psicrotrófica del género Arthrobacter que se encuentra en el agua de los lagos y en el hielo marino antártico. [1] [3] [5] [6] [7] [8] [9] Arthrobacter agilis produce dimetilhexadecilamina y carotenoide . [10] [11]
Arthrobacter agilis es una bacteria psicrotrófica que promueve el crecimiento de las plantas y produce enzimas hidrolíticas activas en frío, aislada del lago Pangong, un lago subglacial en el noroeste del Himalaya, India. [12] El análisis del genoma reveló versatilidad metabólica con genes involucrados en el metabolismo y la adaptación al choque frío, la utilización y la biosíntesis de diversos polisacáridos estructurales y de almacenamiento, como polímeros de carbono de origen vegetal. El genoma de la cepa L77 de Arthrobacter agilis consta de 3.608.439 pb (3,60 Mb) de un cromosoma circular. El genoma comprende 3316 genes codificadores de proteínas y 74 genes de ARN, 725 proteínas hipotéticas, 25 pseudogenes y 1404 genes únicos. [13] Los genes candidatos que codifican enzimas hidrolíticas y proteínas de choque frío se identificaron en el genoma. La cepa L77 de Arthrobacter agilis servirá como fuente de proteínas anticongelantes, enzimas funcionales y otras moléculas bioactivas en futuros proyectos de bioprospección. [14]
Referencias
- ^ desde LPSN lpsn.dsmz.de
- ^ "Información sobre la cepa de Arthrobacter agilis". Archivado desde el original el 11 de octubre de 2016. Consultado el 9 de mayo de 2016 .
- ^ ab Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen [1]
- ^ ATC
- ^ Ulber, vol. ed. Yves Le Gal ; Roldand (2005). Biotecnología marina ([Orden del día]. ed.). Berlín: Springer. ISBN 978-3-540-25669-4.
{{cite book}}
: CS1 maint: varios nombres: lista de autores ( enlace ) - ^ Miller, editado por Robert V.; Whyte, Lyle G. (2012). Microbiología polar: la vida en un congelador profundo . Washington, DC: ASM Press . ISBN 978-1-55581-604-9.
- ^ editores, Antonio Ventosa, Aharon Oren, Yanhe Ma (2011). Halófilos y ambientes hipersalinos: investigación actual y tendencias futuras . Berlín: Springer. ISBN 978-3-642-20198-1. Mantenimiento de CS1: varios nombres: lista de autores ( enlace )
- ^ Atlas, editado por Asim K. Bej, Jackie Aislabie, Ronald M. (2010). Microbiología polar: ecología, biodiversidad y potencial de biorremediación de microorganismos en ambientes extremadamente fríos. Boca Raton: Taylor & Francis . ISBN 978-1-4200-8388-0. Mantenimiento de CS1: varios nombres: lista de autores ( enlace )
- ^ Uniprotección
- ^ Velázquez-Becerra, C; Macías-Rodríguez, LI; López-Bucio, J; Flores-Cortez, I; Santoyo, G; Hernández-Soberano, C; Valencia-Cantero, E (diciembre de 2013). "La rizobacteria Arthrobacter agilis produce dimetilhexadecilamina, un compuesto que inhibe el crecimiento de hongos fitopatógenos in vitro". Protoplasma . 250 (6): 1251–62. doi :10.1007/s00709-013-0506-y. PMID 23674267. S2CID 17393074.
- ^ Kim, editado por Se-Kwon (2013). Caracterización, aislamiento y aplicaciones de biomateriales marinos . Boca Raton: Taylor & Francis. ISBN 978-1-4665-0565-0.
- ^ Yadav, Ajar Nath; Sachan, Shashwati Ghosh; Verma, Priyanka; Tyagi, Satya Prakash; Kaushik, Rajeev; Saxena, Anil K. (5 de noviembre de 2014). "Diversidad cultivable y anotación funcional de bacterias psicrotróficas del desierto frío de Leh Ladakh (India)". Revista mundial de microbiología y biotecnología . 31 (1): 95–108. doi :10.1007/s11274-014-1768-z. ISSN 0959-3993. PMID 25371316. S2CID 35820307.
- ^ Singh, Ram N.; Gaba, Sonam; Yadav, Ajar N.; Gaur, Prakhar; Gulati, Sneha; Kaushik, Rajeev; Saxena, Anil K. (1 de enero de 2016). "Primer borrador de alta calidad de la secuencia genómica de una cepa L77 de Arthrobacter agilis psicrotrófica que promueve el crecimiento de las plantas y produce enzimas activas en frío". Estándares en Ciencias Genómicas . 11 (1): 54. doi : 10.1186/s40793-016-0176-4 . ISSN 1944-3277. PMC 5000428 . PMID 27570579. Este contenido está disponible bajo la Licencia Creative Commons Atribución 4.0.
- ^ Ajar Nath Yadav (2015). "Diversidad bacteriana de desiertos fríos y extracción de genes para tolerancia a bajas temperaturas (Descarga PDF disponible)". ResearchGate . doi :10.13140/rg.2.1.2948.1283/2.
Lectura adicional
- Velázquez-Becerra, C; Macías-Rodríguez, LI; López-Bucio, J; Flores-Cortez, I; Santoyo, G; Hernández-Soberano, C; Valencia-Cantero, E (diciembre de 2013). "La rizobacteria Arthrobacter agilis produce dimetilhexadecilamina, un compuesto que inhibe el crecimiento de hongos fitopatógenos in vitro". Protoplasma . 250 (6): 1251–62. doi :10.1007/s00709-013-0506-y. PMID 23674267. S2CID 17393074.
- Orozco-Mosqueda Mdel, C; Valencia-Cantero, E; López-Albarrán, P; Martínez-Pacheco, M; Velázquez-Becerra, C (2014). "[La bacteria Arthrobacter agilis UMCV2 y diversas aminas inhiben el crecimiento in vitro de hongos que pudren la madera]". Revista Argentina de Microbiología . 47 (3): 219–28. doi : 10.1016/j.ram.2015.06.005 . PMID 26350556.
- Velázquez-Becerra, Crisanto; Macías-Rodríguez, Lourdes Iveth; López-Bucio, José; Altamirano-Hernández, Josué; Flores-Cortez, Idolina; Valencia-Cantero, Eduardo (28 de septiembre de 2010). "Un análisis de compuestos orgánicos volátiles de Arthrobacter agilis identifica dimetilhexadecilamina, un lípido que contiene aminoácidos que modula el crecimiento bacteriano y la morfogénesis de Medicago sativa in vitro". Planta y Suelo . 339 (1–2): 329–340. doi :10.1007/s11104-010-0583-z. S2CID 24280343.
- Editor jefe: George M. Garrity (2012). Manual de bacteriología sistemática de Bergey (2.ª ed.). Nueva York: Springer Science + Business Media. ISBN 978-0-387-68233-4.
- Editor, Naveen Kumar Arora (2013). Simbiosis entre plantas y microbios: fundamentos y avances . Nueva Delhi: Springer. ISBN 978-81-322-1287-4.
- (ed.), Koki Horikoshi (2011). Manual de extremófilos . Tokio: Springer. ISBN 978-4-431-53897-4.
Enlaces externos
- Cepa tipo de Arthrobacter agilis en BacDive, la base de metadatos de diversidad bacteriana