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Arqueoteca de Corinto

Los Korarchaeota son un filo propuesto dentro de Archaea . [3] El nombre se deriva del sustantivo griego koros o kore, que significa hombre joven o mujer joven, y del adjetivo griego archaios que significa antiguo. [4] También se les conoce como Xenarchaeota . El nombre es equivalente a Candidatus Korarchaeota, y también se les conoce con el nombre de Xenarchaeota o Xenarchaea. [5]

Taxonomía

Los Korarchaeota son un filo propuesto en el dominio Archaea . [6] Se cree que divergieron relativamente temprano en la génesis de Archaea y se encuentran entre los linajes de ramificación profunda. [6] Los Korarchaeota también se conocen como Xenarchaeota. Korarchaeaota, junto con Thaumarchaeota, Aigarchaeota, Crenarchaeota, pertenecen al superfilo llamado TACK. [7] El vínculo evolutivo entre las arqueas de Asgard y los Korarchaeota de TACK (Thaumarchaeota, Aigarchaeota, Crenarchaeota, Korarchaeota) aún se desconoce. [7]

El primer miembro de Korarchaeota cuyo genoma fue reconstruido fue Korarchaeum cryptofilum , que fue encontrado en una fuente termal en el Parque Nacional de Yellowstone y descrito en 2008. [8] Desde entonces, solo se han descrito unos pocos genomas de Korarchaeal. [9] Para buscar Korarchaeota, se recolectaron muestras de una variedad de fuentes termales en Islandia y Kamchatka. Según las muestras y el análisis, las muestras islandesas contenían alrededor de 87 secuencias distintas de ácido nucleico ribosómico 16S , mientras que las muestras de Kamchatka contenían alrededor de 33. [10]

Basándose en secuencias de proteínas y análisis filogenéticos de genes individuales conservados, se identificó a Korarchaeota como un “linaje arqueológico profundo” con una posible relación con Crenarchaeota. [11] Además, dada la composición genética conocida de las arqueas, Korarchaeota puede haber conservado un conjunto de rasgos biológicos que corresponden a la forma arqueal más antigua conocida. [11]

El análisis de las secuencias del gen ARNr 16S sugiere que son un linaje de ramificación profunda que no pertenece a los principales grupos arqueológicos, Thermoproteota y Euryarchaeota . [12] El análisis del genoma de un korarchaeote que se enriqueció a partir de un cultivo mixto reveló una serie de características similares a Crenarchaeota y Euryarchaeota y respalda la hipótesis de una ascendencia de ramificación profunda. [13]

Especies

La taxonomía actualmente aceptada se basa en la Lista de nombres procariotas con relevancia en la nomenclatura (LPSN) y el Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI).

A continuación se enumeran las especies conocidas de Korarcheota [14] Candidatus Korarchaeota

Especies de referencia

En 2008 se cultivó una cepa de Korarchaeum cryptofilum a partir de un cultivo de enriquecimiento de una fuente termal del Parque Nacional de Yellowstone (Estados Unidos). [13] Las células son largas y con forma de aguja, lo que le dio a la especie su nombre, en alusión a sus "filamentos crípticos". Este organismo carece de los genes necesarios para la biosíntesis de nucleótidos de purina y, por lo tanto, depende de fuentes ambientales para satisfacer sus necesidades de purina. [17]

Características

Korarchaeota es un filo propuesto dentro del dominio Archaea y, por lo tanto, exhibe características como tener una pared celular sin peptidoglicano, así como membranas lipídicas que están unidas por éter. [18] Tienen una capa superficial de proteína paracristalina. [19] Esta capa superficial, conocida como capa S, está densamente empaquetada y consta de 1-2 proteínas que forman varias estructuras reticulares y es muy probable que sean las que mantienen la integridad estructural de las células. [18] [19] Por lo general, tienen forma de varilla, sin embargo, se ha encontrado que esta morfología puede cambiar a una forma más gruesa en presencia de concentraciones más altas de dodecil sulfato de sodio (SDS). [20] Las células de Korarchaeota tienen una morfología filamentosa ultrafina que puede variar en longitud. [6] Por lo general, tienen un promedio de 15 μm de longitud y 0,16 μm de diámetro, pero se pueden ver de hasta 100 μm de largo. [20] Algunas arqueas pueden fijar dióxido de carbono a través de la vía 3-hidroxipropionato/4-hidroxibutirato en compuestos orgánicos [21]

Ecología

Korarcheota solo se ha encontrado en ambientes hidrotermales que van desde los terrestres, incluidas las fuentes termales [6] [22] hasta los marinos, incluidas las fuentes hidrotermales poco profundas y las fuentes hidrotermales de aguas profundas. [23] Investigaciones anteriores han demostrado una mayor diversidad de Korarchaea encontrada en fuentes termales terrestres en comparación con los ambientes marinos. [23] Korarchaeota se ha encontrado en la naturaleza solo en bajas abundancias. [24] [25] [26] Korarcheota probablemente se originó en ambientes marinos y luego se adaptó a los terrestres. [27]

Geográficamente, se han encontrado Korarcheota en una variedad de lugares alrededor del mundo, incluidos Japón, el Parque Nacional de Yellowstone, el Golfo de California, Islandia y Rusia. [18] [23]

Los korarchaeota son termófilos y se los ha encontrado viviendo en condiciones de hasta 128 grados Celsius. [23] La temperatura más baja en la que se los ha encontrado es de 52 grados Celsius. [18] Si bien se los ha observado con frecuencia viviendo en condiciones ácidas, también se los ha encontrado viviendo en condiciones de hasta un pH de 10. [28] [23]

Los investigadores han identificado un virus que potencialmente puede infectar a Korarcheota. [29]

Se descubrió que cada una de estas seis fuentes termales (desde arriba a la izquierda, en el sentido de las agujas del reloj: Uzon4, Uzon7, Uzon8, Uzon9, Mut11, Mut13) en Kamchatka contenían Korarchaeota.
Se descubrió que cada una de estas seis fuentes termales (en el sentido de las agujas del reloj desde la parte superior izquierda: Uzon4, Uzon7, Uzon8, Uzon9, Mut11, Mut13) en Kamchatka contenía Korarchaeota. [24]







Véase también

Referencias

  1. ^ Resolución de clasificaciones arqueales incompletas y desiguales generalizadas basadas en una taxonomía basada en el genoma normalizado por rangos
  2. ^ El análisis filogenómico del dominio Archaea respalda la fundación del nuevo reino Proteoarchaeota
  3. ^ Véase la página web del NCBI sobre Korarchaeota. Datos extraídos de los "Recursos de taxonomía del NCBI". Centro Nacional de Información Biotecnológica . Consultado el 19 de marzo de 2007 .
  4. ^ Elkins JG, Podar M, Graham DE, Makarova KS, Wolf Y, Randau L, et al. (junio de 2008). "Un genoma korarchaeal revela información sobre la evolución de las arqueas". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 105 (23): 8102–8107. Bibcode :2008PNAS..105.8102E. doi : 10.1073/pnas.0801980105 . PMC 2430366 . PMID  18535141. 
  5. ^ Boone DR, Brenner DJ, Castenholz RW, De Vos P, Garrity GM, Krieg NR, Goodfellow M (2001). Manual de bacteriología sistemática de Bergey (2.ª ed.). Nueva York: Springer. ISBN 978-0-387-21609-6.OCLC 619443681  .
  6. ^ abcdefg Elkins JG, Podar M, Graham DE, Makarova KS, Wolf Y, Randau L, et al. (junio de 2008). "Un genoma korarchaeal revela información sobre la evolución de las arqueas". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 105 (23): 8102–8107. Bibcode :2008PNAS..105.8102E. doi : 10.1073/pnas.0801980105 . PMC 2430366 . PMID  18535141. 
  7. ^ ab Liu Y, Li M (junio de 2022). "La posición evolutiva inestable de Korarchaeota y su relación con otras arqueas TACK y Asgard". mLife . 1 (2): 218–222. doi : 10.1002/mlf2.12020 . ISSN  2770-100X. PMC 10989867 . S2CID  249298036. 
  8. ^ Miller-Coleman RL, Dodsworth JA, Ross CA, Shock EL, Williams AJ, Hartnett HE, et al. (4 de mayo de 2012). "Diversidad, biogeografía y abundancia de Korarchaeota en aguas termales de Yellowstone y la Gran Cuenca y modelado de nichos ecológicos basado en aprendizaje automático". PLOS ONE . ​​7 (5): e35964. doi : 10.1371/journal.pone.0035964 . PMC 3344838 . PMID  22574130. 
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Lectura adicional