Los Korarchaeota son un filo propuesto dentro de Archaea . [3] El nombre se deriva del sustantivo griego koros o kore, que significa hombre joven o mujer joven, y del adjetivo griego archaios que significa antiguo. [4] También se les conoce como Xenarchaeota . El nombre es equivalente a Candidatus Korarchaeota, y también se les conoce con el nombre de Xenarchaeota o Xenarchaea. [5]
Taxonomía
Los Korarchaeota son un filo propuesto en el dominio Archaea . [6] Se cree que divergieron relativamente temprano en la génesis de Archaea y se encuentran entre los linajes de ramificación profunda. [6] Los Korarchaeota también se conocen como Xenarchaeota. Korarchaeaota, junto con Thaumarchaeota, Aigarchaeota, Crenarchaeota, pertenecen al superfilo llamado TACK. [7] El vínculo evolutivo entre las arqueas de Asgard y los Korarchaeota de TACK (Thaumarchaeota, Aigarchaeota, Crenarchaeota, Korarchaeota) aún se desconoce. [7]
El primer miembro de Korarchaeota cuyo genoma fue reconstruido fue Korarchaeum cryptofilum , que fue encontrado en una fuente termal en el Parque Nacional de Yellowstone y descrito en 2008. [8] Desde entonces, solo se han descrito unos pocos genomas de Korarchaeal. [9] Para buscar Korarchaeota, se recolectaron muestras de una variedad de fuentes termales en Islandia y Kamchatka. Según las muestras y el análisis, las muestras islandesas contenían alrededor de 87 secuencias distintas de ácido nucleico ribosómico 16S , mientras que las muestras de Kamchatka contenían alrededor de 33. [10]
Basándose en secuencias de proteínas y análisis filogenéticos de genes individuales conservados, se identificó a Korarchaeota como un “linaje arqueológico profundo” con una posible relación con Crenarchaeota. [11] Además, dada la composición genética conocida de las arqueas, Korarchaeota puede haber conservado un conjunto de rasgos biológicos que corresponden a la forma arqueal más antigua conocida. [11]
El análisis de las secuencias del gen ARNr 16S sugiere que son un linaje de ramificación profunda que no pertenece a los principales grupos arqueológicos, Thermoproteota y Euryarchaeota . [12] El análisis del genoma de un korarchaeote que se enriqueció a partir de un cultivo mixto reveló una serie de características similares a Crenarchaeota y Euryarchaeota y respalda la hipótesis de una ascendencia de ramificación profunda. [13]
A continuación se enumeran las especies conocidas de Korarcheota [14] Candidatus Korarchaeota
Género Candidatus Korarchaeota archaeon [15]
Género Candidatus Korarchaeota archaeon NZ13-K [15]
Género Candidatus Korarchaeum [6]
Especie Candidatus Korarchaeum cryptofilum [6]
Candidatus Korarchaeum criptofilum OPF8 [6]
Género Candidatus Methanodesulfokores [16]
Especie Candidatus Methanodesulfokores washburnensis [16]
Género Korarchaeote SRI-306 [15]
Muestras ambientales del género [15]
pBA5 korarchaeota no cultivada [15]
korarchaeota no cultivada pJP27 [15]
korarchaeota no cultivada pJP78 [15]
Especies de referencia
En 2008 se cultivó una cepa de Korarchaeum cryptofilum a partir de un cultivo de enriquecimiento de una fuente termal del Parque Nacional de Yellowstone (Estados Unidos). [13] Las células son largas y con forma de aguja, lo que le dio a la especie su nombre, en alusión a sus "filamentos crípticos". Este organismo carece de los genes necesarios para la biosíntesis de nucleótidos de purina y, por lo tanto, depende de fuentes ambientales para satisfacer sus necesidades de purina. [17]
Características
Korarchaeota es un filo propuesto dentro del dominio Archaea y, por lo tanto, exhibe características como tener una pared celular sin peptidoglicano, así como membranas lipídicas que están unidas por éter. [18] Tienen una capa superficial de proteína paracristalina. [19] Esta capa superficial, conocida como capa S, está densamente empaquetada y consta de 1-2 proteínas que forman varias estructuras reticulares y es muy probable que sean las que mantienen la integridad estructural de las células. [18] [19] Por lo general, tienen forma de varilla, sin embargo, se ha encontrado que esta morfología puede cambiar a una forma más gruesa en presencia de concentraciones más altas de dodecil sulfato de sodio (SDS). [20] Las células de Korarchaeota tienen una morfología filamentosa ultrafina que puede variar en longitud. [6] Por lo general, tienen un promedio de 15 μm de longitud y 0,16 μm de diámetro, pero se pueden ver de hasta 100 μm de largo. [20] Algunas arqueas pueden fijar dióxido de carbono a través de la vía 3-hidroxipropionato/4-hidroxibutirato en compuestos orgánicos [21]
Ecología
Korarcheota solo se ha encontrado en ambientes hidrotermales que van desde los terrestres, incluidas las fuentes termales [6] [22] hasta los marinos, incluidas las fuentes hidrotermales poco profundas y las fuentes hidrotermales de aguas profundas. [23] Investigaciones anteriores han demostrado una mayor diversidad de Korarchaea encontrada en fuentes termales terrestres en comparación con los ambientes marinos. [23] Korarchaeota se ha encontrado en la naturaleza solo en bajas abundancias. [24] [25] [26] Korarcheota probablemente se originó en ambientes marinos y luego se adaptó a los terrestres. [27]
Geográficamente, se han encontrado Korarcheota en una variedad de lugares alrededor del mundo, incluidos Japón, el Parque Nacional de Yellowstone, el Golfo de California, Islandia y Rusia. [18] [23]
Los korarchaeota son termófilos y se los ha encontrado viviendo en condiciones de hasta 128 grados Celsius. [23] La temperatura más baja en la que se los ha encontrado es de 52 grados Celsius. [18] Si bien se los ha observado con frecuencia viviendo en condiciones ácidas, también se los ha encontrado viviendo en condiciones de hasta un pH de 10. [28] [23]
Los investigadores han identificado un virus que potencialmente puede infectar a Korarcheota. [29]
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