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Arlequín (software)

Arlequin es un software gratuito de genética de poblaciones distribuido como un software de análisis de datos con interfaz gráfica de usuario integrada. [1] Realiza varios tipos de pruebas y cálculos, incluidos el índice de fijación (F st , también conocido como "estadística F" [2] ), el cálculo de la distancia genética , el equilibrio de Hardy-Weinberg , el desequilibrio de ligamiento , el análisis de la varianza molecular , la distribución de desajustes y las pruebas de diferencias por pares. El software está diseñado para poder manejar diferentes tipos de datos moleculares, no moleculares y/o de frecuencia. [3]

Acerca de

Arlequin es un paquete de software que integra niveles/métodos básicos y avanzados para la genética de poblaciones y el análisis de datos. [4]

La versión 3.5.2.2 [1] está disponible sólo en Microsoft Windows como archivo zip y ejecutables de instalación. [1]

Mac OS X y Linux solo tienen la versión 3.5.2 más antigua pero restringida a entornos de 64 bits y solo tienen una interfaz de línea de comandos como el programa "arlecore" [5] , el programa "arlsumstat" [6] , así como los archivos de ejemplo.

En 2019, las nuevas funciones de R se integraron en el software Arlequin. Las nuevas funciones de R pueden integrar el software en archivos zip para las versiones de Windows , Mac y Linux . [7]

Referencias

  1. ^ abc "Arlequin ver 3.5.2.2 (lanzado el 08.02.2015)". 2015-08-02 . Consultado el 17 de enero de 2017 .
  2. ^ Liu, Chun-Fang; Li, Cui; Zhang, Zhen; Wang, Hai-Yan (marzo de 2015). "中国沿海不同地区泥蚶(Tegillarca granosa)的遗传多样性分析" [Diversidad genética de diferentes poblaciones de tegillarca granosa en aguas costeras de China basada en secuencias parciales del gen COI]. Oceanologia et Limnologia Sinica (en chino simplificado). 46 (2): 364–371. doi : 10.11693/hyhz20140400105.
  3. ^ "Arlequin: Acerca de Arlequin". cmpg.unibe.ch . Consultado el 7 de abril de 2023 .
  4. ^ Excoffier, Laurent; Laval, Guillaume; Schneider, Stefan (23 de febrero de 2007). "Arlequin (versión 3.0): un paquete de software integrado para el análisis de datos de genética de poblaciones". Evolutionary Bioinformatics Online . 1 : 47–50. ISSN  1176-9343. PMC 2658868 . PMID  19325852. 
  5. ^ "ARLECORE (v 3.5.2) README.txt". Abril de 2015. Consultado el 17 de enero de 2017 .
  6. ^ "ARLSUMSTAT (v 3.5.2) README.txt". Diciembre de 2009. Consultado el 17 de enero de 2017 .
  7. ^ "Arlequin 3.5". cmpg.unibe.ch . Consultado el 30 de marzo de 2023 .

Enlaces externos